RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592790.1

VMP1-216, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

Gene VMP1, Length 4,325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-216	ENST00000592790	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	C15orf62	A8K5M9	175 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	SLC17A3	O00476	420 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	UPK2	O00526	184 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	SPRY3	O43610	288 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	RAMP3	O60896	148 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	CGA	P01215	116 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	FAM87A	P0C7U9	286 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	LTBR	P36941	435 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	CEACAM3	P40198	252 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	FOXL2	P58012	376 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	RBX1	P62877	108 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	UBE2V1	Q13404	147 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	CT83	Q5H943	113 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	NIT1	Q86X76	327 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	LOXL4	Q96JB6	756 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF714	Q96N38	554 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	GPR82	Q96P67	336 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	GNB4	Q9HAV0	340 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	OR4C46	A6NHA9	309 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790		H0Y8G0	127 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790		K7EP13	123 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	CD55	P08174	381 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	GNG10	P50151	68 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	PSG7	Q13046	419 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	FBLN7	Q53RD9	439 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	MGST2	Q99735	147 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790		A0A1W2PR80	420 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	IGKV1-39	P01597	117 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	IGKV1D-39	P04432	117 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	FABP2	P12104	132 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	IGFBP2	P18065	325 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	EGR1	P18146	543 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	ORM2	P19652	201 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	SSTR5	P35346	364 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	CCL11	P51671	97 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	ERVK11-1	P61568	191 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	CD69	Q07108	199 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM177	Q53S58	311 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	WDR82	Q6UXN9	313 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	TCF23	Q7RTU1	214 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	BLNK	Q8WV28	456 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	TIMD4	Q96H15	378 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	TPPP3	Q9BW30	176 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		2.94	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	PGP	A6NDG6	321 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	F2RL2	O00254	374 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	PRRG2	O14669	202 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	GFRA3	O60609	400 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	OR9G9	P0C7N8	305 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	GLRX	P35754	106 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	RAB9A	P51151	201 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	PSG9	Q00887	426 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	FXYD3	Q14802	87 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	OR8B2	Q96RD0	313 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	RFNG	Q9Y644	331 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	COL4A2	P08572	1712 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	OR2T8	A6NH00	312 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	SRRM5	B3KS81	715 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	WISP1	O95388	367 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	TNFRSF6B	O95407	300 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF83	P51522	516 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	ARF6	P62330	175 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	FOXF2	Q12947	444 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		2.93	□□□□□ -1.94
VMP1-216	ENST00000592790	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		2.93	□□□□□ -1.94

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