RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 RBBP9O75884 186 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 NUDT3O95989 172 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 OR8U9P0C7N5 309 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 LGALS7P47929 136 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 GNG2P59768 71 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM187Q14656 261 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 LAGE3Q14657 143 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 RPL39P5Q59GN2 51 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 OR4X2Q8NGF9 303 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 OR9G4Q8NGQ1 327 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 OR1B1Q8NGR6 318 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 OR8U1Q8NH10 309 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 LGALS14Q8TCE9 139 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 GINS4Q9BRT9 223 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 NOTCH3Q9UM47 2321 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 MGAM2Q2M2H8 2515 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 H7C2Y5 167 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC22A5O76082 557 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 TGFBR1P36897 503 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 CBX5P45973 191 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 RORCP51449 518 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 SLAQ13239 276 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 MMDQ15546 238 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 C5orf64Q2M2E5 130 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF329Q86UD4 541 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 STPG2Q8N412 459 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 WFDC9Q8NEX5 89 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 MAFIPQ8WZ33 124 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00527Q9UJ94 153 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 WASHC3Q9Y3C0 194 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 ANK2Q01484 3957 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM235A6NFC5 223 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 H0YJW9 148 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 M0R1X1 148 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP5LO75964 103 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 NDUFA3O95167 84 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 HLA-DQB1P01920 261 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 APOA2P02652 100 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 SERPINE2P07093 398 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 OR5H8P0DN80 308 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 CNTFRP26992 372 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 THBS3P49746 956 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 VBP1P61758 197 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 PSG5Q15238 335 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 C10orf99Q6UWK7 81 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM131AQ6UXB0 335 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 HOGA1Q86XE5 327 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 LRRC20Q8TCA0 184 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 CD300LFQ8TDQ1 290 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 ACOT12Q8WYK0 555 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 C11orf52Q96A22 123 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC25A46Q96AG3 418 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 OR51J1Q9H342 316 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 TREM1Q9NP99 234 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 SDHAF2Q9NX18 166 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 THYN1Q9P016 225 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 ANXA10Q9UJ72 324 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 C15orf61A6NNL5 157 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 J3QRK9 145 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 FCN1O00602 326 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 HLA-DRB1P01911 266 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 VDAC1P21796 283 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC6A1P30531 599 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 PRSS3P35030 304 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 ALDH3B2P48448 385 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 PAX9P55771 341 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00205P59089 165 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 RND3P61587 244 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 NCS1P62166 190 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 PLGLAQ15195 96 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 ECSCRQ19T08 205 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 TIGITQ495A1 244 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 UBE2NLQ5JXB2 153 aa5.86□□□□□ -1.47
EFTUD2-216ENST00000590105 GPR107Q5VW38 600 aa5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms