RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 GNG7O60262 68 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 MT-CO2P00403 227 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 PSMG4Q5JS54 123 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 LAIR2Q6ISS4 152 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 CNIH2Q6PI25 160 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 AHSA2Q719I0 299 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR1P1Q8NH06 330 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 SECTM1Q8WVN6 248 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 NRG4Q8WWG1 115 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 CYGBQ8WWM9 190 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM203Q969S6 136 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 MISP3Q96FF7 219 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 PLEKHA2Q9HB19 425 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 NSG2Q9Y328 171 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 RFNGQ9Y644 331 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 V9GY05 133 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.31□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 H3BMM0 161 aa7.31□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 NPPCP23582 126 aa7.31□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 P2RY1P47900 373 aa7.31□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 MSMO1Q15800 293 aa7.31□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 PACRGLQ8N7B6 248 aa7.31□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.31□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.31□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR51B2Q9Y5P1 312 aa7.31□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 A0A1W2PS18 150 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 HELTA6NFD8 242 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 DBX1A6NMT0 343 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 GNAO1P09471 354 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 CATR1Q13166 79 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 DHRS2Q13268 280 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 DHRSXQ8N5I4 330 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR13F1Q8NGS4 319 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR51H1Q8NH63 302 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM56Q96MV1 263 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 MARCH11A6NNE9 402 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 PTHLHP12272 177 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 RAB6AP20340 208 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 CRYBB3P26998 211 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 CALRP27797 417 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 AQP4P55087 323 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 CCL18P55774 89 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 FXYD7P58549 80 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 DAD1P61803 113 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 DLK1P80370 383 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 CDNFQ49AH0 187 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 HACD4Q5VWC8 232 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 GSG1LQ6UXU4 331 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 MOB3AQ96BX8 217 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 MND1Q9BWT6 205 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 C8orf4Q9NR00 106 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 FKBP14Q9NWM8 211 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 COMMD9Q9P000 198 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 METTL21EPA6NDL7 271 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 ARL6IP5O75915 188 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM50AO95807 157 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 NUDT3O95989 172 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 FCGR2CP31995 323 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 RANBP1P43487 201 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 PPP5CP53041 499 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 ERVK-16P61578 105 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 RPS25P62851 125 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 SPHARQ15513 63 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 METTL26Q96S19 204 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC5A7Q9GZV3 580 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 ATG5Q9H1Y0 275 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q9H8V8 135 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDNEP1-202ENST00000570380 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM235A6NFC5 223 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 SSX5O60225 188 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 SNAPC5O75971 98 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 KRASP01116 189 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 PPYP01298 95 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 HLA-DRB4P13762 266 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 G6PCP35575 357 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 NPBWR1P48145 328 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR10A3P58181 314 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 ARL6IP1Q15041 203 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 AADACL3Q5VUY0 350 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 CADM3Q8N126 398 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF114Q8NC26 417 aa7.27□□□□□ -1.25
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