RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568622.1

KIAA0556-208, Transcript of KIAA0556, humanhuman

TSL 2

Gene KIAA0556, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556-208ENST00000568622 TMEM187Q14656 261 aa8.08□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 IDNKQ5T6J7 187 aa8.08□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.08□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 TCF24Q7RTU0 167 aa8.08□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.08□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 ST8SIA2Q92186 375 aa8.08□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.08□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 HINT2Q9BX68 163 aa8.08□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.08□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 VCX3BQ9H321 246 aa8.08□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 DIABLOQ9NR28 239 aa8.08□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 EHFQ9NZC4 300 aa8.08□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.07□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.07□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.07□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 MEIS3P1A6NDR6 274 aa8.07□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8.07□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 GPR31O00270 319 aa8.07□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 DEFB131AP59861 70 aa8.07□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 PAFAH1B2P68402 229 aa8.07□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.07□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.07□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 CMTM1Q8IZ96 169 aa8.07□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 GBGT1Q8N5D6 347 aa8.07□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 CMTM3Q96MX0 182 aa8.07□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 X6R8D5 127 aa8.07□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.06□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 A0A1B0GU03 582 aa8.06□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 IGLL5B9A064 214 aa8.06□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 YIF1AO95070 293 aa8.06□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 MIFP14174 115 aa8.06□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 LEMD1Q68G75 181 aa8.06□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.06□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.06□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 MISP3Q96FF7 219 aa8.06□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 GINS3Q9BRX5 216 aa8.06□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 PKD1P98161 4303 aa8.06□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 K7EQG2 157 aa8.05□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 GNG7O60262 68 aa8.05□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 IGHV3-48P01763 117 aa8.05□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 PMP2P02689 132 aa8.05□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 P0C879 139 aa8.05□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 C4BPBP20851 252 aa8.05□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 TAS2R46P59540 309 aa8.05□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF600Q6ZNG1 722 aa8.05□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 Q6ZTC4 211 aa8.05□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 DUSP18Q8NEJ0 188 aa8.05□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 OR6F1Q8NGZ6 308 aa8.05□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.05□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 IFT46Q9NQC8 304 aa8.05□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.04□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 ST8SIA3O43173 380 aa8.04□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 TMEM50AO95807 157 aa8.04□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 AMBPP02760 352 aa8.04□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 SPP1P10451 314 aa8.04□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 HLA-DMBP28068 263 aa8.04□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 NPBWR1P48145 328 aa8.04□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 UCP3P55916 312 aa8.04□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 TAS2R20P59543 309 aa8.04□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.04□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 OR5H2Q8NGV7 314 aa8.04□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 DCANP1Q8TF63 244 aa8.04□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 RNF126Q9BV68 326 aa8.04□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.03□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa8.03□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 MED14OSP0DP75 135 aa8.03□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 CRYBB3P26998 211 aa8.03□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 HRH1P35367 487 aa8.03□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 PHLDA2Q53GA4 152 aa8.03□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 UBE2NLQ5JXB2 153 aa8.03□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 LPCAT3Q6P1A2 487 aa8.03□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 STHQ8IWL8 128 aa8.03□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 TSPAN14Q8NG11 270 aa8.03□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 GPX8Q8TED1 209 aa8.03□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 MRGPRFQ96AM1 343 aa8.03□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 U3KQE9 123 aa8.03□□□□□ -1.12
KIAA0556-208ENST00000568622 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.02□□□□□ -1.13
KIAA0556-208ENST00000568622 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
KIAA0556-208ENST00000568622 RTL8CO15255 209 aa8.02□□□□□ -1.13
KIAA0556-208ENST00000568622 IGKV1-5P01602 117 aa8.02□□□□□ -1.13
KIAA0556-208ENST00000568622 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
KIAA0556-208ENST00000568622 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
KIAA0556-208ENST00000568622 TGFBR1P36897 503 aa8.02□□□□□ -1.13
KIAA0556-208ENST00000568622 ERHP84090 104 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
KIAA0556-208ENST00000568622 BSXQ3C1V8 233 aa8.02□□□□□ -1.13
KIAA0556-208ENST00000568622 TMEM69Q5SWH9 247 aa8.02□□□□□ -1.13
KIAA0556-208ENST00000568622 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa8.02□□□□□ -1.13
KIAA0556-208ENST00000568622 CROCCP3Q8IVE0 287 aa8.02□□□□□ -1.13
KIAA0556-208ENST00000568622 OR4A16Q8NH70 328 aa8.02□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms