RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	OR4F4	Q96R69	305 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744		A0A0G2JLM5	398 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	CCL24	O00175	119 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	SYNGR2	O43760	224 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	MT-CO2	P00403	227 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	IFNA10	P01566	189 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	NPY1R	P25929	384 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	S100A10	P60903	97 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	OXA1L	Q15070	435 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	MLANA	Q16655	118 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF114	Q8NC26	417 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	OR1P1	Q8NH06	330 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	DPF1	Q92782	380 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	C2orf50	Q96LR7	162 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	CCDC140	Q96MF4	163 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	C7orf66	A4D0T2	115 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	LINC01619	G3V211	115 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744		K7EIM0	57 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	CYB5B	O43169	146 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	MED6	O75586	246 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	BRI3	O95415	125 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	GPR183	P32249	361 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	HTR2B	P41595	481 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF616	Q08AN1	781 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	FCN2	Q15485	313 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744		Q56UQ5	140 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	USMG5	Q96IX5	58 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	OR4C12	Q96R67	309 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	OR2T8	A6NH00	312 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	C15orf62	A8K5M9	175 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744		I3L2K1	104 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744		K7EPK0	472 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	BMPR1B	O00238	502 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	CCNK	O75909	580 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	OR8U8	P0C7N1	319 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	CD33	P20138	364 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	ARL3	P36405	182 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	MYCNOS	P40205	109 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	OPRK1	P41145	380 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	RUNX1	Q01196	453 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	ID3	Q02535	119 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	RAB32	Q13637	225 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	BSX	Q3C1V8	233 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	C2orf83	Q53S99	150 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	ACSM6	Q6P461	480 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	DCUN1D4	Q92564	292 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	MED28	Q9H204	178 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	THYN1	Q9P016	225 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744		F8W735	103 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744		L7N2F9	121 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	OR2C1	O95371	312 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM50A	O95807	157 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	IFNA4	P05014	189 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	CLEC3B	P05452	202 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	CXCL3	P19876	107 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	BCAP31	P51572	246 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	PAX9	P55771	341 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	H2BFS	P57053	126 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	VAMP2	P63027	116 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	FHL3	Q13643	280 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	RPEL1	Q2QD12	228 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	KLK9	Q2XQG4	91 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	PRR31	Q5SQ13	230 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	TREML4	Q6UXN2	200 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RPL4-208	ENST00000564744	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		6.53	□□□□□ -1.36

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