RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563951.1

CCDC33-211, Transcript of coiled-coil domain containing 33, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC33, Length 308 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33-211ENST00000563951 OR2C1O95371 312 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 DHFRP00374 187 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 AKR1C4P17516 323 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 ADMP35318 185 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 ARL3P36405 182 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 PPP1R1AQ13522 171 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 BSXQ3C1V8 233 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 TRIQKQ629K1 86 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 IL22RA2Q969J5 263 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 TENM3Q9P273 2699 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC33-211ENST00000563951 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 C2orf70A6NJV1 201 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 A8MWP6 167 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 TGOLN2O43493 480 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 NDUFB6O95139 128 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 IGHV3-48P01763 117 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 CLEC3BP05452 202 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 FAM209BQ5JX69 171 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 FAM219AQ8IW50 185 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 CXorf58Q96LI9 332 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 A0A0B4J2A0 478 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 OR2T8A6NH00 312 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 LGALS9O00182 355 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 PITX3O75364 302 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 ATG12O94817 140 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 NXPH3O95157 252 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 SFT2D2O95562 160 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 MT-CO2P00403 227 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 IFNA17P01571 189 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 GP9P14770 177 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 SPCS3P61009 180 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 GPHB5Q86YW7 130 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 LRTM2Q8N967 370 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 OR52E5Q8NH55 327 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 MISP3Q96FF7 219 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 OR4C12Q96R67 309 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 FOLR2P14207 255 aa6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 LGI3Q8N145 548 aa6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 Q8N1Y9 231 aa6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 ATP6V0BQ99437 205 aa6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 CCDC32Q9BV29 185 aa6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 THYN1Q9P016 225 aa6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 MLXQ9UH92 298 aa6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.44□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.43□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 C9orf170A2RU37 121 aa6.43□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 LYRM1O43325 122 aa6.43□□□□□ -1.38
CCDC33-211ENST00000563951 LY86O95711 162 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms