RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558836.5

CUX1-217, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CUX1, Length 2,965 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-217ENST00000558836 CD24P25063 80 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 NDUFA6P56556 154 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 TMEM177Q53S58 311 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 SLC16A13Q7RTY0 426 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 OR5B3Q8NH48 314 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 FAM210BQ96KR6 192 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 SIRT7Q9NRC8 400 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 DOK5Q9P104 306 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 ONECUT1Q9UBC0 465 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.58□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.57□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 B4DEV8 164 aa8.57□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 LY86O95711 162 aa8.57□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 OR10J4P0C629 311 aa8.57□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 LINC00869P0C866 280 aa8.57□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 PPOXP50336 477 aa8.57□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 RAB31Q13636 194 aa8.57□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.57□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.57□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 NDUFS7O75251 213 aa8.57□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 ARF6P62330 175 aa8.57□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 PMS2P11Q13670 270 aa8.57□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 FKBP11Q9NYL4 201 aa8.57□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 A0A1W2PPR1 153 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 CXorf65A6NEN9 183 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 CXorf1O96002 111 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 RD3LP0DJH9 198 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 GCHFRP30047 84 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 MAS1LP35410 378 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 ERHP84090 104 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 PRR20EP86478 221 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 PRR20CP86479 221 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 PRR20DP86480 221 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 PRR20BP86481 221 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 PRR20AP86496 221 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 COTL1Q14019 142 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 MALSU1Q96EH3 234 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 IGHV2-70P01814 119 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 USF1P22415 310 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 ZNF90Q03938 601 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 C2orf83Q53S99 150 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 MORN5Q5VZ52 161 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 PDPNQ86YL7 162 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 PNKDQ8N490 385 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 RAB1CQ92928 201 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 UHRF2Q96PU4 802 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 INSIG2Q9Y5U4 225 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 MYO18BQ8IUG5 2567 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 IGSF10Q6WRI0 2623 aa8.56□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 A0A0U1RQK1 487 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 A0A1W2PPI3 338 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 A0A1W2PPQ1 181 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 C22orf46C9J442 243 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 H7BYZ3 331 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 HIST1H2BKO60814 126 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 IGHV2-5P01817 119 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 HIST1H2BJP06899 126 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 HIST1H2BOP23527 126 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 HIST1H2BBP33778 126 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 HIST1H2BDP58876 126 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 RHOBP62745 196 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 HIST1H2BCP62807 126 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 CD69Q07108 199 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 PSG5Q15238 335 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 TNXAQ16473 311 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 NPIPB3Q92617 1050 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 FRZBQ92765 325 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 AP4M1O00189 453 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 OR7C2O60412 319 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 AREGP15514 252 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 CDKN1AP38936 164 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 UQCRFS1P47985 274 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 LINC00311Q8N616 119 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 NIT2Q9NQR4 276 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.55□□□□□ -1.04
CUX1-217ENST00000558836 UBE2CO00762 179 aa8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms