RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546997.1

BRF1-208, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-208	ENST00000546997	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-208	ENST00000546997	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-208	ENST00000546997	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-208	ENST00000546997	SFRP2	Q96HF1	295 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-208	ENST00000546997	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-208	ENST00000546997	NUPR1	O60356	82 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	NPPC	P23582	126 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	SSTR5	P35346	364 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	CFAP161	Q6P656	301 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	C15orf65	H3BRN8	121 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	MGST3	O14880	152 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	ADM	P35318	185 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	EFNA4	P52798	201 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	CST9LP1	Q5W188	147 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	RNF2	Q99496	336 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	COX19	Q49B96	90 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	RFESD	Q8TAC1	157 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	OR2D2	Q9H210	308 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		13.44	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	IGHV4-39	P01824	125 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	REG1A	P05451	166 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	CRISP2	P16562	243 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	EDDM3B	P56851	147 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	GNB1	P62873	340 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	HTD2	P86397	168 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	OR5I1	Q13606	314 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	CR1L	Q2VPA4	569 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	SLC35E1	Q96K37	410 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	ODAM	A1E959	279 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	SPINT2	O43291	252 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997		P0C879	139 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	RAB7A	P51149	207 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	KRTAP10-9	P60411	292 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	DTD1	Q8TEA8	209 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	C5orf30	Q96GV9	206 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		13.43	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	ITGB1BP1	O14713	200 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	FSTL3	O95633	263 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	IL36B	Q9NZH7	164 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	MPDU1	O75352	247 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	PF4V1	P10720	104 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	CTRL	P40313	264 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	LINC00310	P59036	64 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	TCF23	Q7RTU1	214 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		13.41	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	ITPR2	Q14571	2701 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	TIMD4	Q96H15	378 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BRF1-208	ENST00000546997	RAMP3	O60896	148 aa		13.4	□□□□□ -0.27
BRF1-208	ENST00000546997	SERF1A	O75920	110 aa		13.4	□□□□□ -0.27
BRF1-208	ENST00000546997	NDUFB4	O95168	129 aa		13.4	□□□□□ -0.27
BRF1-208	ENST00000546997	MT-ND6	P03923	174 aa		13.4	□□□□□ -0.27
BRF1-208	ENST00000546997	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		13.4	□□□□□ -0.27
BRF1-208	ENST00000546997	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		13.4	□□□□□ -0.27
BRF1-208	ENST00000546997	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.27
BRF1-208	ENST00000546997	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		13.4	□□□□□ -0.27

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