RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544805.1

RNF10-222, Transcript of ring finger protein 10, human

TSL 2

Gene RNF10, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF10-222	ENST00000544805	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	FUT9	Q9Y231	359 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805		A0A1B0GW64	132 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	NTN1	O95631	604 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	PMS2P2	O95744	297 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	FREM3	P0C091	2139 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	CXCL3	P19876	107 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	SPHAR	Q15513	63 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	OR7A5	Q15622	319 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	KIR2DL4	Q99706	377 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	DNAJC13	O75165	2243 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	LRRK2	Q5S007	2527 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805		A0A1W2PP11	408 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	FAM231B	A6NCW3	169 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	AGPAT2	O15120	278 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	BCL2L11	O43521	198 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	CGA	P01215	116 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	IGHV3-9	P01782	118 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	CRYBB3	P26998	211 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF92	Q03936	586 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	GSG1	Q2KHT4	349 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	IL17D	Q8TAD2	202 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	AP1S3	Q96PC3	154 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	S1PR3	Q99500	378 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	SPIN2A	Q99865	258 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	CHST6	Q9GZX3	395 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	FZR1	Q9UM11	496 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RNF10-222	ENST00000544805	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	SHISA3	A0PJX4	238 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805		M0R1X1	148 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	RHOD	O00212	210 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	NPFF	O15130	113 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	SLC2A10	O95528	541 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	IGLC2	P0DOY2	106 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	IGLC3	P0DOY3	106 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	REG1B	P48304	166 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF83	P51522	516 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	CATR1	Q13166	79 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	ADIRF	Q15847	76 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805		Q6ZTK2	550 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	AAED1	Q7RTV5	226 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805		Q8N1Y9	231 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	OR2T29	Q8NH02	315 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	PIFO	Q8TCI5	191 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF524	Q96C55	264 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	MBD6	Q96DN6	1003 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	SEC22A	Q96IW7	307 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	RARRES2	Q99969	163 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	KLK11	Q9UBX7	282 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	HCFC1	P51610	2035 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805		A0A1B0GWA3	101 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RNF10-222	ENST00000544805	C5orf49	A4QMS7	147 aa		7.32	□□□□□ -1.24

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