RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	OR1P1	Q8NH06	330 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	RNF2	Q99496	336 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	TSC22D3	Q99576	134 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777		V9GYH0	126 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	C15orf61	A6NNL5	157 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC190	Q86UF4	302 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	MISP3	Q96FF7	219 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	KLK11	Q9UBX7	282 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CHEK1	O14757	476 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	YIF1A	O95070	293 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	HLA-DMA	P28067	261 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	S100G	P29377	79 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	HRH1	P35367	487 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	TFPI2	P48307	235 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	MFAP4	P55083	255 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	IL18	Q14116	193 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF79	Q15937	498 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDX11-222	ENST00000542777	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777		I3L2K1	104 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	TSPAN5	P62079	268 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF124	Q15973	351 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	OR4A16	Q8NH70	328 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	SEC22A	Q96IW7	307 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	TXN2	Q99757	166 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	CSTL1	Q9H114	145 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		11.82	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	FABP12	A6NFH5	140 aa		11.82	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	MT-CO2	P00403	227 aa		11.82	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	OR10C1	Q96KK4	312 aa		11.82	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	BATF3	Q9NR55	127 aa		11.82	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		11.82	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	MPTX1	A8MV57	137 aa		11.81	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	GABARAP	H6UMI1	98 aa		11.81	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777		M0QYG6	137 aa		11.81	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	IGKV1-39	P01597	117 aa		11.81	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV3-48	P01763	117 aa		11.81	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	IGKV1D-39	P04432	117 aa		11.81	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		11.81	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		11.81	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF114	Q8NC26	417 aa		11.81	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		11.81	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		11.81	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	RARRES2	Q99969	163 aa		11.81	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		11.8	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		11.8	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	CTDSPL	O15194	276 aa		11.8	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	GNG7	O60262	68 aa		11.8	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	RCVRN	P35243	200 aa		11.8	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	PAFAH1B2	P68402	229 aa		11.8	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	PRCD	Q00LT1	54 aa		11.8	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		11.8	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		11.8	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	CD3D	P04234	171 aa		11.79	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	S100A5	P33763	92 aa		11.79	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	UCP3	P55916	312 aa		11.79	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		11.79	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	TCF24	Q7RTU0	167 aa		11.79	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	TRIM63	Q969Q1	353 aa		11.79	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	GINS3	Q9BRX5	216 aa		11.79	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	SRR	Q9GZT4	340 aa		11.79	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	CD5	P06127	495 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	ETV6	P41212	452 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	OR11H2	Q8NH07	326 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DDX11-222	ENST00000542777	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
DDX11-222	ENST00000542777	ST8SIA3	O43173	380 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDX11-222	ENST00000542777	NPBWR1	P48145	328 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDX11-222	ENST00000542777	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
DDX11-222	ENST00000542777	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDX11-222	ENST00000542777	PYDC2	Q56P42	97 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDX11-222	ENST00000542777	SPINK9	Q5DT21	86 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDX11-222	ENST00000542777	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDX11-222	ENST00000542777	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDX11-222	ENST00000542777	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		11.77	□□□□□ -0.53

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