RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 SPINK9Q5DT21 86 aa8.71□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.71□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 Q6ZRM9 215 aa8.71□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 RNF183Q96D59 192 aa8.71□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.71□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.7□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.7□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.7□□□□□ -1.02
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CLSTN3-211ENST00000541667 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.7□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A0J9YWU9 116 aa8.7□□□□□ -1.02
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CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM50AO95807 157 aa8.7□□□□□ -1.02
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CLSTN3-211ENST00000541667 ARRDC1Q8N5I2 433 aa8.7□□□□□ -1.02
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CLSTN3-211ENST00000541667 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.7□□□□□ -1.02
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CLSTN3-211ENST00000541667 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.7□□□□□ -1.02
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CLSTN3-211ENST00000541667 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.69□□□□□ -1.02
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CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1B0GU03 582 aa8.69□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 OR4C46A6NHA9 309 aa8.69□□□□□ -1.02
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CLSTN3-211ENST00000541667 RAB3DO95716 219 aa8.66□□□□□ -1.02
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CLSTN3-211ENST00000541667 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 CSTL1Q9H114 145 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 GPR132Q9UNW8 380 aa8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
CLSTN3-211ENST00000541667 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.65□□□□□ -1.02
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