RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534645.1

RCE1-208, Transcript of Ras converting CAAX endopeptidase 1, human

TSL 5

Gene RCE1, Length 300 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCE1-208	ENST00000534645	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	DBX1	A6NMT0	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	LGALS9	O00182	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	TGOLN2	O43493	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	OR2C1	O95371	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	IGKV1-5	P01602	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	IL5	P05113	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	SRPX	P78539	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	DHRS2	Q13268	280 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	OR1P1	Q8NH06	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	IL22RA2	Q969J5	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	MISP3	Q96FF7	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645		A0A0B4J2A0	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645		A0A0G2JRQ6	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	TMEM213	A2RRL7	107 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	OR2T8	A6NH00	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645		K7EIM0	57 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	PRAF2	O60831	178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	IFNA17	P01571	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	CLEC3B	P05452	202 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	HOXB5	P09067	269 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645		P0C879	139 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	FOLR2	P14207	255 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	MFAP2	P55001	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	OXA1L	Q15070	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645		Q56UQ5	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	SPINK9	Q5DT21	86 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	MITD1	Q8WV92	249 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	GPR146	Q96CH1	333 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	ENY2	Q9NPA8	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645		A0A0B4J293	547 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	CORT	O00230	105 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	NDUFA4	O00483	81 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	ADAP1	O75689	374 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	IFNA21	P01568	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	EDN2	P20800	178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	SNCA	P37840	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	CD81	P60033	236 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	GUCA2B	Q16661	112 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RCE1-208	ENST00000534645		Q6ZRM9	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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