RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 OR2C1O95371 312 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF846Q147U1 533 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SMCO1Q147U7 214 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 IL34Q6ZMJ4 242 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PEMTQ9UBM1 199 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 C9orf170A2RU37 121 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 I3L2K1 104 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 GPHB5Q86YW7 130 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 MRAPQ8TCY5 172 aa14.5□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A1B0GU03 582 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 F8W735 103 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 K7EIL1 84 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 LGALS9O00182 355 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 TGOLN2O43493 480 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 NXPH3O95157 252 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 OR4E1P0C645 316 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 BSXQ3C1V8 233 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PVRIGQ6DKI7 326 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PLET1Q6UQ28 207 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 C20orf85Q9H1P6 137 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 TMED3Q9Y3Q3 217 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 OR2T8A6NH00 312 aa14.48□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 CEBPZOSA8MTT3 80 aa14.48□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 CORTO00230 105 aa14.48□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 MT-CO2P00403 227 aa14.48□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 IGLV1-51P01701 117 aa14.48□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 CSN3P07498 182 aa14.48□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC25A6P12236 298 aa14.48□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 TNFRSF9Q07011 255 aa14.48□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 DHRS2Q13268 280 aa14.48□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 LYG2Q86SG7 212 aa14.48□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 HSPB7Q9UBY9 170 aa14.48□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 TBC1D24Q9ULP9 559 aa14.48□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 UPK1BO75841 260 aa14.47□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 TCRBP04435 133 aa14.47□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 HTR2BP41595 481 aa14.47□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM106AQ4KMX7 169 aa14.47□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 Q56UQ5 140 aa14.47□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SPSB3Q6PJ21 355 aa14.47□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 HAPLN4Q86UW8 402 aa14.47□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 UBAC2Q8NBM4 344 aa14.47□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 OR1S1Q8NH92 325 aa14.47□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PRR25Q96S07 402 aa14.47□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 A8MWP6 167 aa14.46□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 PITX3O75364 302 aa14.46□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 HOXB5P09067 269 aa14.46□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 MFAP4P55083 255 aa14.46□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 ASAH1Q13510 395 aa14.46□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 C4orf46Q504U0 113 aa14.46□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC24A4Q8NFF2 622 aa14.46□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 COQ8AQ8NI60 647 aa14.46□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 TXN2Q99757 166 aa14.46□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 HIPK2Q9H2X6 1198 aa14.46□□□□□ -0.09
PACSIN3-208ENST00000531226 C2orf70A6NJV1 201 aa14.45□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 SPNP16150 400 aa14.45□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 ADMP35318 185 aa14.45□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 C2orf83Q53S99 150 aa14.45□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 GGNBP1Q5YKI7 109 aa14.45□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 MZT2BQ6NZ67 158 aa14.45□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 CHRDL1Q9BU40 450 aa14.45□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 RBKSQ9H477 322 aa14.45□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 NUDT15Q9NV35 164 aa14.45□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 TRAV6A0A075B6T7 132 aa14.44□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa14.44□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF320A2RRD8 509 aa14.44□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 LY86O95711 162 aa14.44□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 IGHV3-48P01763 117 aa14.44□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 C11orf87Q6NUJ2 197 aa14.44□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa14.44□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa14.44□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 DTD1Q8TEA8 209 aa14.44□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa14.43□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM213A2RRL7 107 aa14.43□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM90A26D6RGX4 464 aa14.43□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 CTSGP08311 255 aa14.43□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 GP9P14770 177 aa14.43□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 EDN2P20800 178 aa14.43□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 NPY1RP25929 384 aa14.43□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 OPRK1P41145 380 aa14.43□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 DUSP18Q8NEJ0 188 aa14.43□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM190Q8WZ59 177 aa14.43□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 PALMDQ9NP74 551 aa14.43□□□□□ -0.1
PACSIN3-208ENST00000531226 NDUFA4O00483 81 aa14.42□□□□□ -0.1
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