RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529998.5

UBASH3B-205, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 698 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-205ENST00000529998 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.64□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.64□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.64□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.64□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 CXorf58Q96LI9 332 aa6.64□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.64□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 NUDT15Q9NV35 164 aa6.64□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 THYN1Q9P016 225 aa6.64□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 A0A1B0GU03 582 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 F8W735 103 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 I3L2K1 104 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 WIPF1O43516 503 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 PITX3O75364 302 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 ADAP1O75689 374 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 IGHV3-48P01763 117 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 GPR183P32249 361 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 ARL3P36405 182 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 SNCAP37840 140 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 BSXQ3C1V8 233 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 OR1S1Q8NH92 325 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 MISP3Q96FF7 219 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 RBKSQ9H477 322 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 ENY2Q9NPA8 101 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 OR2T8A6NH00 312 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 MPTX1A8MV57 137 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 SAP30O75446 220 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 MT-CO2P00403 227 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 SLC25A6P12236 298 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 TNFRSF9Q07011 255 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 MLANAQ16655 118 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 FAM209BQ5JX69 171 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 GPHB5Q86YW7 130 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 COQ8AQ8NI60 647 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 MITD1Q8WV92 249 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 TGOLN2O43493 480 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 CSN3P07498 182 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 CTSGP08311 255 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 EDN2P20800 178 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 ADMP35318 185 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 HTR2BP41595 481 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 INSL3P51460 131 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 TATDN3Q17R31 274 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 C2orf83Q53S99 150 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 Q56UQ5 140 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 PLET1Q6UQ28 207 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 DTD1Q8TEA8 209 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 OR4C12Q96R67 309 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF320A2RRD8 509 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 LGALS9O00182 355 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 MFAP4P55083 255 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 ENKURQ8TC29 256 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 OR10C1Q96KK4 312 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 ATP6V0BQ99437 205 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 TXN2Q99757 166 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 C2orf70A6NJV1 201 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-205ENST00000529998 K7EIL1 84 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms