RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 HIST1H2BNQ99877 126 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 HIST1H2BMQ99879 126 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 DRC3Q9H069 523 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 KLK9Q9UKQ9 250 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 USP24Q9UPU5 2620 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 HECW2Q9P2P5 1572 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 DOCK3Q8IZD9 2030 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 KMT2DO14686 5537 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 TOPBP1Q92547 1522 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 FUOMA2VDF0 154 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR2T1O43869 369 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR1I1O60431 355 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 DEXIO95424 95 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 APOEP02649 317 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 UCHL3P15374 230 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 MYL12AP19105 171 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 HBA1P69905 142 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 STX5Q13190 355 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMED1Q13445 227 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 PDE6HQ13956 83 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCNJ8Q15842 424 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 IQCF2Q8IXL9 164 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR4D11Q8NGI4 311 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR5A1Q8NGJ0 315 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 TERB2Q8NHR7 220 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 MCFD2Q8NI22 146 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 GINS4Q9BRT9 223 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM147Q9BVK8 224 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 PKIGQ9Y2B9 76 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 E9PCH4 1651 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF462Q96JM2 2506 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 A0A0A6YYH2 397 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRAV3A0A0B4J244 114 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 A6NJ64 397 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 LRRN3E7EW58 273 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 HYPMO75409 117 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 MGST1P10620 155 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 RPS20P60866 119 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 RAB5BP61020 215 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 IFITM2Q01629 132 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 KHDC3LQ587J8 217 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPANXN3Q5MJ09 141 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM86BQ8N661 226 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR4E2Q8NGC2 313 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 ULBP3Q9BZM4 244 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 FBXL12Q9NXK8 326 aa0.19□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAT4Q6V0I7 4981 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 ECM29Q5VYK3 1845 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 PQLC2LA1A4F0 135 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCNK1O00180 336 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAAHO00519 579 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC16A4O15374 487 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 TGOLN2O43493 480 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 LYZL6O75951 148 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 OCM2P0CE71 109 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 MIFP14174 115 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 RHEBQ15382 184 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 DEFB113Q30KQ7 82 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPRNQ5BIV9 151 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 GDF5OSQ5U4N7 250 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 C8orf74Q6P047 294 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 DPPA3Q6W0C5 159 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 MIR17HGQ75NE6 70 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 DEFB128Q7Z7B8 93 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC35B4Q969S0 331 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 LINC00526Q96FQ7 95 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 CFAP53Q96M91 514 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 ACER3Q9NUN7 267 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 DPRXA6NFQ7 191 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 UBL3O95164 117 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 HLA-DRB1P01911 266 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 TNNC2P02585 160 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 RPL5P46777 297 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 CDC42P60953 191 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP0.17□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 CDKL4Q5MAI5 379 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPANXN5Q5MJ07 72 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR13C4Q8NGS5 318 aa0.17□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms