RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516443.1

RNU6-687P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 687, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-687P, Length 89 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-687P-201ENST00000516443 MESTQ5EB52 335 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-687P-201ENST00000516443 PMF1Q6P1K2 205 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-687P-201ENST00000516443 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-687P-201ENST00000516443 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-687P-201ENST00000516443 OR51A7Q8NH64 312 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-687P-201ENST00000516443 OR8D1Q8WZ84 308 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-687P-201ENST00000516443 GNB1LQ9BYB4 327 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-687P-201ENST00000516443 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-687P-201ENST00000516443 C14orf132Q9NPU4 83 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-687P-201ENST00000516443 TRAV10A0A0B4J240 114 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 A0A0G2JMM0 328 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 A0A1W2PPB8 328 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 FABP5P3A8MUU1 101 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 KIR3DP1A8MWS1 328 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 CASQ1P31415 396 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 FXYD3Q14802 87 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 EBPQ15125 230 aaKnown RBP-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 CCDC152Q4G0S7 254 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 Q5XG85 94 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 OR52L1Q8NGH7 329 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 CANT1Q8WVQ1 401 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 LRRC45Q96CN5 670 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 ISOC1Q96CN7 298 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZNF714Q96N38 554 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 SCGB3A1Q96QR1 104 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 DSCR8Q96T75 97 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 SNX6Q9UNH7 406 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 PRELID1Q9Y255 219 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 ACACAQ13085 2346 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 DNAH7Q8WXX0 4024 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 MYLKQ15746 1914 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 A0A0C4DFX4 3053 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 A6NN06 94 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 I3L521 148 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 LSM1O15116 133 aaKnown RBP-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 BATFQ16520 125 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 HIKESHIQ53FT3 197 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 TPRG1LQ5T0D9 272 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 OR2W3Q7Z3T1 314 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 C5orf56Q8N8D9 126 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 OR4A15Q8NGL6 344 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 Q8TAT8 98 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 TMEM237Q96Q45 408 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 RAB1BQ9H0U4 201 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 ARMC7Q9H6L4 198 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 COL6A5A8TX70 2615 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 SACSQ9NZJ4 4579 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 GPR171O14626 319 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 CXCL8P10145 99 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 ESRGQ1W209 222 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 NATD1Q8N6N6 113 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 OR10AG1Q8NH19 301 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 C9orf72Q96LT7 481 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 GSDMAQ96QA5 445 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 GPER1Q99527 375 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 DMAC2Q9NW81 257 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 MOSPD1Q9UJG1 213 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 PCTPQ9UKL6 214 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 ANAPC10Q9UM13 185 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 OR2AG2A6NM03 316 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 FGF6P10767 208 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 HMOX2P30519 316 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 SNAP25P60880 206 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 LINC00299Q6ZSB3 139 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 BHLHE23Q8NDY6 225 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 OR2T35Q8NGX2 323 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 C20orf24Q9BUV8 137 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 GON7Q9BXV9 100 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 BEX2Q9BXY8 128 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 SBF1O95248 1867 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 DNAJC13O75165 2243 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 TTC41PQ6P2S7 1318 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 APOBP04114 4563 aaKnown RBP-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 KRT87PA6NCN2 255 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 MGAT4DA6NG13 374 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 GATCO43716 136 aaKnown RBP-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 KDELR3O43731 214 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 ERC2-IT1O76042 136 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 VAPBO95292 243 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 PTNP21246 168 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 KLKP1Q107X0 134 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 C4orf22Q6V702 233 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-687P-201ENST00000516443 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa-3.39□□□□□ -2.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms