RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa5.11□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 NDUFA11Q86Y39 141 aa5.11□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 SUN5Q8TC36 379 aa5.11□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM230Q96A57 120 aa5.11□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 TP53RKQ96S44 253 aa5.11□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 OR2T8A6NH00 312 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 K7EQM0 130 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 GNG7O60262 68 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 S100A10P60903 97 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 CNPY1Q3B7I2 92 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 TEX45Q8NA69 505 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 TUBA4BQ9H853 241 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 OVOL1O14753 267 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 SOX15O60248 233 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 S100A9P06702 114 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 BCAP31P51572 246 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC190Q86UF4 302 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 C8orf31Q8N9H6 132 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 FXYD6Q9H0Q3 95 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 NUDT15Q9NV35 164 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 DEFA1P59665 94 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 DEFA3P59666 94 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC25A42Q86VD7 318 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 DCUN1D4Q92564 292 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 HIPK2Q9H2X6 1198 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 C16orf95Q9H693 158 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 AKIP1Q9NQ31 210 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.1□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 SSNA1O43805 119 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 IL7P13232 177 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 CNN1P51911 297 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 DHRS11Q6UWP2 260 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 LYZL2Q7Z4W2 148 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 GBGT1Q8N5D6 347 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 COMMD1Q8N668 190 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 OR52B4Q8NGK2 314 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 PRNDQ9UKY0 176 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 GPR132Q9UNW8 380 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A087WW49 117 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 CCSO14618 274 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 SPDEFO95238 335 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 TBPP20226 339 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF137PP52743 207 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 FOXE3Q13461 319 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 SPANXN5Q5MJ07 72 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 OR8G2PQ6IF36 304 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 LGI3Q8N145 548 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 SLA2Q9H6Q3 261 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 NAA60Q9H7X0 242 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 ZFP57Q9NU63 452 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 MMP24Q9Y5R2 645 aa5.09□□□□□ -1.59
RRN3P1-201ENST00000514813 E7EUB6 86 aa5.09□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 LINC01619G3V211 115 aa5.09□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 L7N2F9 121 aa5.09□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 UPK2O00526 184 aa5.09□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 ITGB1BP1O14713 200 aa5.09□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 TRBV12-3P01733 135 aa5.09□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 TAS2R31P59538 309 aa5.09□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 OR2F1Q13607 317 aa5.09□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM106AQ4KMX7 169 aa5.09□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM71F2Q6NXP2 309 aa5.09□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 SEC22AQ96IW7 307 aa5.09□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 RNF5Q99942 180 aa5.09□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM231Q9H6L2 316 aa5.09□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 FKBP11Q9NYL4 201 aa5.09□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 LYRM1O43325 122 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 PRAF2O60831 178 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 NDUFB8O95169 186 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 OR8U8P0C7N1 319 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 ZP3P21754 424 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 AKIRIN2Q53H80 203 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 PRR31Q5SQ13 230 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 VAX1Q5SQQ9 334 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 GDPD1Q8N9F7 314 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 FGF2P09038 288 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 STAG3L3P0CL85 134 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 CAV2P51636 162 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 EBI3Q14213 229 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 COQ8AQ8NI60 647 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.08□□□□□ -1.6
RRN3P1-201ENST00000514813 RABAC1Q9UI14 185 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms