RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510204.5

SH3BP2-217, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 3,617 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.77□□□□□ -0.84
SH3BP2-217ENST00000510204 OR51H1Q8NH63 302 aa9.77□□□□□ -0.84
SH3BP2-217ENST00000510204 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 A0A1W2PRD5 423 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 A0A1W2PRF3 423 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 A0A1W2PRM7 423 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 NAPSAO96009 420 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 IGKV1-13P0DP09 117 aa9.77□□□□□ -0.85
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SH3BP2-217ENST00000510204 TNFRSF1AP19438 455 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 GNB1P62873 340 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.77□□□□□ -0.85
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SH3BP2-217ENST00000510204 IGHV3-7P01780 117 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 PPIFP30405 207 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
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SH3BP2-217ENST00000510204 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.77□□□□□ -0.85
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SH3BP2-217ENST00000510204 KCNS2Q9ULS6 477 aa9.77□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa9.76□□□□□ -0.85
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SH3BP2-217ENST00000510204 IGKV1D-12P01611 117 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 CRYAAP02489 173 aa9.76□□□□□ -0.85
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SH3BP2-217ENST00000510204 ZXDAP98168 799 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 OR4A16Q8NH70 328 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 KLRF1Q9NZS2 232 aa9.76□□□□□ -0.85
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SH3BP2-217ENST00000510204 NCOR1O75376 2440 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 A0A1W2PNR3 127 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 F5H768 121 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 TUSC2O75896 110 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 SCTP09683 121 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 TMEM78Q5T7P6 136 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF441Q8N8Z8 693 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 ENY2Q9NPA8 101 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 OR1A1Q9P1Q5 309 aa9.76□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 MT-ND6P03923 174 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 RPL7P18124 248 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM159AQ6UWV7 190 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 KIR2DL4Q99706 377 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 TMEM147Q9BVK8 224 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 OR2W1Q9Y3N9 320 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 C3orf80F5H4A9 247 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 MT-CO3P00414 261 aa9.75□□□□□ -0.85
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SH3BP2-217ENST00000510204 ERVK11-1P61568 191 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 FOXI1Q12951 378 aa9.75□□□□□ -0.85
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SH3BP2-217ENST00000510204 Q6ZPA2 131 aa9.75□□□□□ -0.85
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SH3BP2-217ENST00000510204 C3orf56Q8N813 242 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 FSCN3Q9NQT6 498 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 C21orf140B9A014 251 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 H3BMG7 143 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 SMRP1Q8NCR6 262 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.75□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF576Q9H609 170 aa9.75□□□□□ -0.85
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SH3BP2-217ENST00000510204 FNDC10F2Z333 226 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 CXorf1O96002 111 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 SLC35B1P78383 322 aa9.74□□□□□ -0.85
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SH3BP2-217ENST00000510204 MMD2Q8IY49 270 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 CFHR4Q92496 578 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.74□□□□□ -0.85
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SH3BP2-217ENST00000510204 TCL1AP56279 114 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 Q6ZRM9 215 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 PRELID3AQ96N28 172 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 TMEM133Q9H2Q1 129 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
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SH3BP2-217ENST00000510204 FAM90A16PA6NEW6 464 aa9.74□□□□□ -0.85
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SH3BP2-217ENST00000510204 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM90A7PA6NKC0 464 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM90A22PA8MWA6 464 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM90A12PA8MX19 464 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 EFNA2O43921 213 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM90A15PP0C7V4 464 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM90A13PP0C7W8 464 aa9.74□□□□□ -0.85
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