RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 PALMDQ9NP74 551 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 C21orf62Q9NYP8 219 aa11.22□□□□□ -0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAV6A0A075B6T7 132 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 IL5P05113 134 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 HOXB5P09067 269 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 ARL3P36405 182 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 NPBWR1P48145 328 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 SAMD5Q5TGI4 173 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 REC114Q7Z4M0 266 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 C1QL4Q86Z23 238 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 DCUN1D4Q92564 292 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 MISP3Q96FF7 219 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 OR4C12Q96R67 309 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 MGAM2Q2M2H8 2515 aa11.21□□□□□ -0.61
SH3BP2-208ENST00000504294 SEC14L6B5MCN3 397 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 WIPF1O43516 503 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 CLEC3BP05452 202 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 RELQ04864 619 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 C2orf83Q53S99 150 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 CLEC19AQ6UXS0 136 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 GPHB5Q86YW7 130 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC24A4Q8NFF2 622 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF502Q8TBZ5 544 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 DTD1Q8TEA8 209 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 PRR13Q9NZ81 148 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 LGALS9O00182 355 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 WRBO00258 174 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 PITX3O75364 302 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 IFNA10P01566 189 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 IGLL1P15814 213 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 NPY1RP25929 384 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 SLURP1P55000 103 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 RAB11AP62491 216 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 PVRIGQ6DKI7 326 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 SCARB1Q8WTV0 552 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 SNRPGP15A8MWD9 76 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 MT-CO2P00403 227 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC25A4P12235 298 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 BSXQ3C1V8 233 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 Q56UQ5 140 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 SPINK9Q5DT21 86 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 ACSM6Q6P461 480 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 OR9G4Q8NGQ1 327 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 MFSD2BA6NFX1 497 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 I3L2K1 104 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 K7EIM0 57 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 BMPR1BO00238 502 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 TGOLN2O43493 480 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 SYNGR2O43760 224 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 GNG7O60262 68 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 SAP30O75446 220 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 OPRK1P41145 380 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 IFITM3Q01628 133 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 OXLD1Q5BKU9 147 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 NRARPQ7Z6K4 114 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 MARVELD1Q9BSK0 173 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 RBKSQ9H477 322 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 UFC1Q9Y3C8 167 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 G3V4G9 280 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 PTTG1O95997 202 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 GPR183P32249 361 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 MFAP2P55001 183 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 ELLP55199 621 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 SYNJ2BPP57105 145 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 DEFA5Q01523 94 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 ID3Q02535 119 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 BEAN1Q3B7T3 259 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 C19orf35Q6ZS72 473 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 UXS1Q8NBZ7 420 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 OR2K2Q8NGT1 345 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 MARC2Q969Z3 335 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC140Q96MF4 163 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 DMRT1Q9Y5R6 373 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 C5orf51A6NDU8 294 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 NDUFA4O00483 81 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 ADAP1O75689 374 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 IGHV3-23P01764 117 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 IFNA4P05014 189 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 BMI1P35226 326 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP2-208ENST00000504294 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms