RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 TSSK6Q9BXA6 273 aa5.55□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.55□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa5.55□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 DPM3Q9P2X0 92 aa5.55□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 RIC1Q4ADV7 1423 aa5.55□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 UBR2Q8IWV8 1755 aa5.55□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 MYH13Q9UKX3 1938 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 WDR62O43379 1518 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1B0GW54 56 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 EPOPA6NHQ4 379 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 C9JQL5 133 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 K7N7A8 449 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 CD5LO43866 347 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 FSTL3O95633 263 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 HRASP01112 189 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 IGLV3-27P01718 113 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 NMBP08949 121 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 IGHV3-43DP0DP04 118 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 CRYGAP11844 174 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 FABP4P15090 132 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF20P17024 532 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 AQP1P29972 269 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 CSRP3P50461 194 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF138P52744 262 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 FOXI1Q12951 378 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM183AQ8IXX5 376 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 C10orf111Q8N326 155 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 YIPF7Q8N8F6 280 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF799Q96GE5 643 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF702PQ9H963 129 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 FAM60AQ9NP50 221 aa5.54□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 ABCC2Q92887 1545 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 TRAV41A0A0B4J266 112 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1W2PS18 150 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 K7EP34 96 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 TSHBP01222 138 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 GYPAP02724 150 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 S100A4P26447 101 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 MPGP29372 298 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF83P51522 516 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 LSM3P62310 102 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 Q0VG73 95 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 OR2T2Q6IF00 324 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 PCSK4Q6UW60 755 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 RFLNBQ8N5W9 214 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 DDB2Q92466 427 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 SIX2Q9NPC8 291 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 RABAC1Q9UI14 185 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 SLIT3O75094 1523 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 SIPA1L1O43166 1804 aa5.53□□□□□ -1.52
PDCD4-211ENST00000498367 ABCC5O15440 1437 aa5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 ATRNO75882 1429 aa5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 A0A1B0GVT2 93 aa5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 CYB5AP00167 134 aa5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 TRACP01848 142 aa5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 HLA-DRB4P13762 266 aa5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 ICAM4Q14773 271 aa5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 EBLN2Q6P2I7 272 aa5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 RFLNAQ6ZTI6 216 aa5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF584Q8IVC4 421 aa5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 OTOSQ8NHW6 89 aa5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 PGLYRP2Q96PD5 576 aa5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 NPVFQ9HCQ7 196 aa5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 AIG1Q9NVV5 245 aa5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 LINC00312Q9Y6C7 94 aa5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 PLIN4Q96Q06 1357 aa5.52□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 C2orf16Q68DN1 1984 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 M0R2P5 195 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 SOCS1O15524 211 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 HLA-DPB1P04440 258 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 CRISP2P16562 243 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 HIST1H2BOP23527 126 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 HIST1H2BBP33778 126 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 ASIPP42127 132 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 NMUP48645 174 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 HIST1H2BDP58876 126 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 HIST1H2BCP62807 126 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 Q6ZSN1 163 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCD4-211ENST00000498367 PRNTQ86SH4 94 aa5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms