RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497287.5

GPATCH4-208, Transcript of G-patch domain containing 4, human

TSL 3

Gene GPATCH4, Length 837 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPATCH4-208	ENST00000497287	PRSS46	E5RG02	174 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	FBXO24	O75426	580 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	IGHG2	P01859	326 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	AMY1A	P04745	511 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	SRD5A1	P18405	259 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	NDP	Q00604	133 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	IFITM2	Q01629	132 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	CD69	Q07108	199 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	VWC2	Q2TAL6	325 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	LFNG	Q8NES3	379 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	MISP3	Q96FF7	219 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	SLC35E1	Q96K37	410 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	SMR3A	Q99954	134 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	GINS3	Q9BRX5	216 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	ARV1	Q9H2C2	271 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	HIVEP2	P31629	2446 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	RGS13	O14921	159 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	ATP6V0E1	O15342	81 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	MPDU1	O75352	247 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	IGF1	P05019	195 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	FGF7	P21781	194 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	OPRK1	P41145	380 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	BLCAP	P62952	87 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	AKR1C1	Q04828	323 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	RAB31	Q13636	194 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	ECSCR	Q19T08	205 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	ZNF709	Q8N972	641 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	OR5T1	Q8NG75	326 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	THYN1	Q9P016	225 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	LINC01548	A6NM66	108 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	TRIM77	I1YAP6	450 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	AP4M1	O00189	453 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	SOX15	O60248	233 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	MT-CO2	P00403	227 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	SEC11B	P0C7V7	166 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	SPP1	P10451	314 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	ATP6V0C	P27449	155 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	MFAP2	P55001	183 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	RAB14	P61106	215 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	GAMT	Q14353	236 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	TEPP	Q6URK8	271 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	BTNL8	Q6UX41	500 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	TMED6	Q8WW62	240 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	JMJD8	Q96S16	334 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	ZNF580	Q9UK33	172 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	UMAD1	C9J7I0	102 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287		G3V318	75 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287		H3BUA1	57 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	CLDN34	H7C241	214 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287		I3L2K1	104 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	RAB5C	P51148	216 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	RIPPLY3	P57055	190 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GPATCH4-208	ENST00000497287	SERF2	P84101	59 aa		5.74	□□□□□ -1.49

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