RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 ASAH1Q13510 395 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 SMCO1Q147U7 214 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 RPEL1Q2QD12 228 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 LYG2Q86SG7 212 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 CXorf58Q96LI9 332 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 NUDT15Q9NV35 164 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 THYN1Q9P016 225 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 A0A1B0GU03 582 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 MPTX1A8MV57 137 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 F8W735 103 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 I3L2K1 104 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 CYB5BO43169 146 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 PITX3O75364 302 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 ADAP1O75689 374 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 OR2C1O95371 312 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 MT-CO2P00403 227 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 IGHV3-48P01763 117 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 CLEC3BP05452 202 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 GPR183P32249 361 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 ARL3P36405 182 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 C4orf46Q504U0 113 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 ACSM6Q6P461 480 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 COQ8AQ8NI60 647 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 MISP3Q96FF7 219 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 ENY2Q9NPA8 101 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 OR2T8A6NH00 312 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 FAM229AH3BQW9 127 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 SAP30O75446 220 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 EDN2P20800 178 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 SNCAP37840 140 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 TNFRSF9Q07011 255 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 BSXQ3C1V8 233 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 FAM209BQ5JX69 171 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 OR1S1Q8NH92 325 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 ENKURQ8TC29 256 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 MITD1Q8WV92 249 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 RBKSQ9H477 322 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 VWFP04275 2813 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 TGOLN2O43493 480 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 CSN3P07498 182 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 SLC25A6P12236 298 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 MLANAQ16655 118 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 Q56UQ5 140 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 PLET1Q6UQ28 207 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 DTD1Q8TEA8 209 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PKP4-216ENST00000495123 FBN3Q75N90 2809 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 CORTO00230 105 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 CCSO14618 274 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 IAPPP10997 89 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 ADMP35318 185 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 OPRK1P41145 380 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 HTR2BP41595 481 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 INSL3P51460 131 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 MFAP4P55083 255 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 TATDN3Q17R31 274 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 C2orf83Q53S99 150 aa6.58□□□□□ -1.36
PKP4-216ENST00000495123 REC114Q7Z4M0 266 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms