RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492766.5

RERE-215, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, human

TSL 3

Gene RERE, Length 367 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RERE-215	ENST00000492766	HOXB5	P09067	269 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	GPR183	P32249	361 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	TNFRSF9	Q07011	255 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	RPEL1	Q2QD12	228 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	OR1S1	Q8NH92	325 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	COQ8A	Q8NI60	647 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	ENKUR	Q8TC29	256 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	MISP3	Q96FF7	219 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766		F8W735	103 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766		I3L2K1	104 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	SLC25A6	P12236	298 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	ARL3	P36405	182 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	SYNJ2BP	P57105	145 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	MITD1	Q8WV92	249 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	RBKS	Q9H477	322 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	MPTX1	A8MV57	137 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	MT-CO2	P00403	227 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	SNCA	P37840	140 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	ACSM6	Q6P461	480 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RERE-215	ENST00000492766	TGOLN2	O43493	480 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	SAP30	O75446	220 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	DEFA1	P59665	94 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	DEFA3	P59666	94 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	KRTAP10-11	P60412	298 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	DTD1	Q8TEA8	209 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	SORL1	Q92673	2214 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	OR2T8	A6NH00	312 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	CORT	O00230	105 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	OR2C1	O95371	312 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	IGHV3-48	P01763	117 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	CLEC3B	P05452	202 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	NPY1R	P25929	384 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	HTR2B	P41595	481 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	10.38	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	C2orf83	Q53S99	150 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766		Q56UQ5	140 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	REC114	Q7Z4M0	266 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	ATP6V0B	Q99437	205 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	CCS	O14618	274 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	IFNA21	P01568	189 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	IAPP	P10997	89 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	ADM	P35318	185 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	INSL3	P51460	131 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	PLET1	Q6UQ28	207 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766		A8MWP6	167 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	LGALS9	O00182	355 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	IL5	P05113	134 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	CSN3	P07498	182 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	SPN	P16150	400 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	EDN2	P20800	178 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	OPRK1	P41145	380 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	MFAP4	P55083	255 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	GPHB5	Q86YW7	130 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	OR10C1	Q96KK4	312 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
RERE-215	ENST00000492766	TMEM213	A2RRL7	107 aa		10.35	□□□□□ -0.75

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