RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANXA3	P12429	323 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	AREG	P15514	252 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	CXCL2	P19875	107 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	S100G	P29377	79 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	LGALS7	P47929	136 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	BLCAP	P62952	87 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	CX3CL1	P78423	397 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	WT1-AS	Q06250	92 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF5	Q99942	180 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	NMES1	Q9C002	83 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	COA4	Q9NYJ1	87 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGSF23	A1L1A6	192 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEDD	O75618	318 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	CA2	P00918	260 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	HRAS	P01112	189 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLEC3B	P05452	202 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBP1	P09467	338 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	IAPP	P10997	89 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC25A4	P12235	298 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM11	P17152	192 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSMB6	P28072	239 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	AKR1C2	P52895	323 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	BPIFB3	P59826	476 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNFRSF9	Q07011	255 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	MMD	Q15546	238 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	AANAT	Q16613	207 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	C11orf88	Q6PI97	169 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	WFDC1	Q9HC57	220 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	MBD2	Q9UBB5	411 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	NF1	P21359	2839 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	SOX15	O60248	233 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFNA21	P01568	189 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	C1QB	P02746	253 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM106CP	P0CH98	169 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	APELA	P0DMC3	54 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	BRS3	P32247	399 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERVK-16	P61578	105 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	HES1	Q14469	280 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR4A5	Q8NH83	315 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF702P	Q9H963	129 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266		G3V318	75 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266		H3BP45	60 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	WRB	O00258	174 aa		4.78	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms