RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486812.5

PRDM15-212, Transcript of PR/SET domain 15, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM15, Length 7,072 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15-212ENST00000486812 CCL4L1Q8NHW4 92 aa8.7□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 MGST3O14880 152 aa8.7□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 ZIC3O60481 467 aa8.7□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 PDLIM4P50479 330 aa8.7□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 IGLC1P0CG04 106 aa8.7□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.7□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.7□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 H3BTX0 84 aa8.7□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 AMN1Q8IY45 258 aa8.7□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.7□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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PRDM15-212ENST00000486812 ASCL5Q7RTU5 278 aa8.69□□□□□ -1.02
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PRDM15-212ENST00000486812 DEFB127Q9H1M4 99 aa8.69□□□□□ -1.02
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PRDM15-212ENST00000486812 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.69□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.69□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 C9orf172C9J069 976 aa8.69□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 RBX1P62877 108 aa8.69□□□□□ -1.02
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PRDM15-212ENST00000486812 MESP2Q0VG99 397 aa8.68□□□□□ -1.02
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PRDM15-212ENST00000486812 SCN8AQ9UQD0 1980 aa8.68□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 C22orf46C9J442 243 aa8.68□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 IGHG4P01861 327 aa8.68□□□□□ -1.02
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PRDM15-212ENST00000486812 COX14Q96I36 57 aa8.68□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa8.68□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 D6R8Y8 96 aa8.68□□□□□ -1.02
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PRDM15-212ENST00000486812 NPFFO15130 113 aa8.68□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 NPIPB13A6NJU9 1138 aa8.68□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 FSCN3Q9NQT6 498 aa8.68□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.68□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 H0Y8X5 98 aa8.68□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 SLC25A20O43772 301 aa8.68□□□□□ -1.02
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PRDM15-212ENST00000486812 DEPPQ9NTK1 212 aa8.68□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa8.68□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
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PRDM15-212ENST00000486812 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.67□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 APELAP0DMC3 54 aa8.67□□□□□ -1.02
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PRDM15-212ENST00000486812 RGPD5Q99666 1765 aa8.67□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 DOCK2Q92608 1830 aa8.67□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 YPEL1O60688 119 aa8.67□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 ACYP1P07311 99 aa8.67□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 YPEL2Q96QA6 119 aa8.67□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.67□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.67□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 COX7A1P24310 79 aa8.66□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 GLRXP35754 106 aa8.66□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 PSG4Q00888 419 aa8.66□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.66□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 PTPRFP10586 1907 aa8.66□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa8.66□□□□□ -1.02
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PRDM15-212ENST00000486812 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.66□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.66□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 VWC2LB2RUY7 222 aa8.66□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 EGR4Q05215 589 aa8.66□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa8.66□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa8.66□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 REG1BP48304 166 aa8.66□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 GFERP55789 205 aa8.66□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 SYNJ2BPP57105 145 aa8.66□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 RGPD2P0DJD1 1756 aa8.66□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 MPV17P39210 176 aa8.66□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 MDP1Q86V88 176 aa8.66□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 ARAP2Q8WZ64 1704 aa8.65□□□□□ -1.02
PRDM15-212ENST00000486812 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa8.65□□□□□ -1.02
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