RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 VENTXO95231 258 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 SIX6O95475 246 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 SFT2D2O95562 160 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 DHFRP00374 187 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 KRASP01116 189 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV1-39P01597 117 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV1-16P04430 117 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV1D-39P04432 117 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 F2RP25116 425 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 G6PCP35575 357 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF137PP52743 207 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 CX3CL1P78423 397 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 DHODHQ02127 395 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 CATR1Q13166 79 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM187Q14656 261 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 TATDN3Q17R31 274 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM128Q5BJH2 165 aa3.71□□□□□ -1.82
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PTPRC-211ENST00000484135 LYG2Q86SG7 212 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
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PTPRC-211ENST00000484135 GLYATL2Q8WU03 294 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 SGK494Q96LW2 274 aa3.71□□□□□ -1.82
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PTPRC-211ENST00000484135 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 NSG2Q9Y328 171 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 TMED3Q9Y3Q3 217 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 MXRA5Q9NR99 2828 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 ZFHX3Q15911 3703 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0G2JRQ6 117 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
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PTPRC-211ENST00000484135 FAM25EA8MYX2 175 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 H0Y980 276 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 FCN1O00602 326 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 SSNA1O43805 119 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV1-5P01602 117 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 APOA2P02652 100 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 OPN1MWP04001 364 aa3.7□□□□□ -1.82
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PTPRC-211ENST00000484135 SERPINE2P07093 398 aa3.7□□□□□ -1.82
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PTPRC-211ENST00000484135 OPN1MW3P0DN78 364 aa3.7□□□□□ -1.82
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PTPRC-211ENST00000484135 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
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PTPRC-211ENST00000484135 TAS2R31P59538 309 aa3.7□□□□□ -1.82
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PTPRC-211ENST00000484135 PJVKQ0ZLH3 352 aa3.7□□□□□ -1.82
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PTPRC-211ENST00000484135 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 ETFRF1Q6IPR1 90 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF695Q8IW36 515 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 SLC35G3Q8N808 338 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
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PTPRC-211ENST00000484135 SEC22AQ96IW7 307 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 ADTRPQ96IZ2 230 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 SPXQ9BT56 116 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM222Q9H0R3 208 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 OR51J1Q9H342 316 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 FBXL15Q9H469 300 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 WASHC3Q9Y3C0 194 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 F8P00451 2351 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRC-211ENST00000484135 TXNL1O43396 289 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 CHST1O43916 411 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 CDS2O95674 445 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 HPRT1P00492 218 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 MOSP00540 346 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 IGLV2-23P01705 113 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 OR9G9P0C7N8 305 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 APELAP0DMC3 54 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 ANXA3P12429 323 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 CXCL3P19876 107 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 UCP1P25874 307 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 CD1BP29016 333 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-211ENST00000484135 IER3P46695 156 aa3.69□□□□□ -1.82
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