RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482563.1

RBM39-233, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 1,737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-233	ENST00000482563	TLCD2	A6NGC4	264 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-233	ENST00000482563	OR2T1	O43869	369 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-233	ENST00000482563	AKR1C2	P52895	323 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-233	ENST00000482563	LINC01554	Q52M75	96 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-233	ENST00000482563	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-233	ENST00000482563	OR4K15	Q8NH41	348 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-233	ENST00000482563	OR4C6	Q8NH72	309 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-233	ENST00000482563	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-233	ENST00000482563	CALML5	Q9NZT1	146 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-233	ENST00000482563	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-233	ENST00000482563	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM39-233	ENST00000482563	ODAM	A1E959	279 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	CCL5	P13501	91 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	KISS1	Q15726	138 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	UBE2S	Q16763	222 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	AGRN	O00468	2067 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563		A0A0B4J2C4	111 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	IGKV1-16	P04430	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF286B	P0CG31	522 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	MSMO1	Q15800	293 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	VCX	Q9H320	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	CKLF	Q9UBR5	152 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	GGT3P	A6NGU5	568 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	NDUFB2	O95178	105 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563		P0DMU3	169 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	FAM231A	P0DMU4	169 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	FAM231C	P0DMU5	169 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	EVI2A	P22794	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	CRHBP	P24387	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	NEDD8	Q15843	81 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	TERB2	Q8NHR7	220 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	SIPA1L1	O43166	1804 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	SPEF2	Q9C093	1822 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	COL18A1	P39060	1754 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	GNG7	O60262	68 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	LY6H	O94772	140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	MT-ND4L	P03901	98 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	NDP	Q00604	133 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	SLC25A16	P16260	332 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	TPST1	O60507	370 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	CXCL1	P09341	107 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	TAS2R20	P59543	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	TP53RK	Q96S44	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	SCN1A	P35498	2009 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563		A8MWP6	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	LYZL6	O75951	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF19	P17023	458 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF79	Q15937	498 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	CROCCP2	Q86T23	111 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms