RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 IFT46Q9NQC8 304 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 DIABLOQ9NR28 239 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 PRNDQ9UKY0 176 aa6.87□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 C15orf61A6NNL5 157 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 C16orf90A8MZG2 172 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3-48P01763 117 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 PMP2P02689 132 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 MFAP4P55083 255 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 TCTAP57738 103 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 TCF24Q7RTU0 167 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 LILRB2Q8N423 598 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM56Q96MV1 263 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 CMTM3Q96MX0 182 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB26Q9ULW5 256 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.86□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR31O00270 319 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 MT-CO2P00403 227 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM187Q14656 261 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 LEMD1Q68G75 181 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF114Q8NC26 417 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 ST8SIA2Q92186 375 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 TSC22D3Q99576 134 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 TXN2Q99757 166 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.85□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 GNG7O60262 68 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 DFFBO76075 338 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 NAT1P18440 290 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 TAS2R46P59540 309 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 DEFB131AP59861 70 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 PAFAH1B2P68402 229 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 PRCDQ00LT1 54 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 Q8NAQ8 132 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 SEC22AQ96IW7 307 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 GINS3Q9BRX5 216 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 VSIRQ9H7M9 311 aa6.84□□□□□ -1.31
SMARCE1-210ENST00000481231 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 ST8SIA3O43173 380 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV1-39P01597 117 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV1D-39P04432 117 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 CD5P06127 495 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 HRH1P35367 487 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 TAS2R20P59543 309 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4A16Q8NH70 328 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 HRH4Q9H3N8 390 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1B0GU03 582 aa6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 C11orf94C9JXX5 98 aa6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM127O75204 238 aa6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 HLA-DMAP28067 261 aa6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 HLA-DMBP28068 263 aa6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 TGFBR1P36897 503 aa6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 NPBWR1P48145 328 aa6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 NEDD8Q15843 81 aa6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 SPINK9Q5DT21 86 aa6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 STHQ8IWL8 128 aa6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 C4BPBP20851 252 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 S100GP29377 79 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 PRSS3P35030 304 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 Q6ZTC4 211 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.81□□□□□ -1.32
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