RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 SHPKQ9UHJ6 478 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAME-211ENST00000476336 UFC1Q9Y3C8 167 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAME-211ENST00000476336 ZNF320A2RRD8 509 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-211ENST00000476336 C2orf70A6NJV1 201 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-211ENST00000476336 IGHV3-23P01764 117 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-211ENST00000476336 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PRAME-211ENST00000476336 SULT1A3P0DMM9 295 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-211ENST00000476336 SULT1A4P0DMN0 295 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-211ENST00000476336 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PRAME-211ENST00000476336 MFAP4P55083 255 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-211ENST00000476336 RELQ04864 619 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PRAME-211ENST00000476336 TMEM187Q14656 261 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-211ENST00000476336 GTSCR1Q86UQ5 136 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-211ENST00000476336 TMEM230Q96A57 120 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-211ENST00000476336 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PRAME-211ENST00000476336 COL7A1Q02388 2944 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 K7EIM0 57 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 NDUFA4O00483 81 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 FOLR2P14207 255 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 CBLN1P23435 193 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 HTR2BP41595 481 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 NPBWR1P48145 328 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 CCR6P51684 374 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 MFAP2P55001 183 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 Q56UQ5 140 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 CENPSQ8N2Z9 138 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 DUSP18Q8NEJ0 188 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 LHFPL5Q8TAF8 219 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 MISP3Q96FF7 219 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 HIPK2Q9H2X6 1198 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 S4R3C0 116 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 A0A1B0GU03 582 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 OR2T8A6NH00 312 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 A8MZ25 164 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 I3L2K1 104 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 SLC25A6P12236 298 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 PVRIGQ6DKI7 326 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 TMED4Q7Z7H5 227 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 LRTM2Q8N967 370 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 UBAC2Q8NBM4 344 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 GPR146Q96CH1 333 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 CACNG5Q9UF02 275 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 TRAV25A0A0B4J276 109 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 A0A0G2JRQ6 117 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 C15orf62A8K5M9 175 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 K7EMT4 169 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 GNG7O60262 68 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 MT-CO2P00403 227 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 C8orf88P0DMB2 117 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 VAMP1P23763 118 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 SMCO1Q147U7 214 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 BAK1Q16611 211 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 DEFB114Q30KQ6 69 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 BSXQ3C1V8 233 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 ANKRD55Q3KP44 614 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 NMSQ5H8A3 153 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 Q6ZRM9 215 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 TMEM190Q8WZ59 177 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 TMED3Q9Y3Q3 217 aa10.12□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 TMEM213A2RRL7 107 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 CEBPZOSA8MTT3 80 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 NDUFB6O95139 128 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 CTSGP08311 255 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 BMI1P35226 326 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 C2orf83Q53S99 150 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 ETFRF1Q6IPR1 90 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 UXS1Q8NBZ7 420 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 S100ZQ8WXG8 99 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 CCDC32Q9BV29 185 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 U3KQ87 197 aa10.11□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 FAM90A26D6RGX4 464 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 F8W735 103 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 SFT2D2O95562 160 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 CD5P06127 495 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 SLC25A4P12235 298 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 IL7P13232 177 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 OPRK1P41145 380 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 SPINK9Q5DT21 86 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 SLC16A13Q7RTY0 426 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 LYZL2Q7Z4W2 148 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 GINS3Q9BRX5 216 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 HSPB7Q9UBY9 170 aa10.1□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 MED6O75586 246 aa10.09□□□□□ -0.79
PRAME-211ENST00000476336 ADMP35318 185 aa10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms