RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469793.1

RAD18-208, Transcript of RAD18, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 2

Gene RAD18, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD18-208	ENST00000469793	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RAD18-208	ENST00000469793		A0A1W2PRX2	142 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793		M0QZ24	198 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	SIX6	O95475	246 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	SCGB1D2	O95969	90 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	IAPP	P10997	89 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	H2BFS	P57053	126 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	CXorf58	Q96LI9	332 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	RAB40C	Q96S21	281 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	MED28	Q9H204	178 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793		I3L2K1	104 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793		K7EIM0	57 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793		K7EPK0	472 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	SSSCA1	O60232	199 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	IFNA10	P01566	189 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	IGHV3-11	P01762	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	TAS2R30	P59541	319 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	SMIM8	Q96KF7	97 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	OR4F4	Q96R69	305 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	ATP6V0B	Q99437	205 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	RAB32	Q13637	225 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	FHL3	Q13643	280 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	FCN2	Q15485	313 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	ASB13	Q8WXK3	278 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	MISP3	Q96FF7	219 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	CCDC140	Q96MF4	163 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	VWF	P04275	2813 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	C15orf62	A8K5M9	175 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	TSC22D2	O75157	780 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	TMEM50A	O95807	157 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	MT-CO2	P00403	227 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	CXCL3	P19876	107 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	PAX9	P55771	341 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	RAB11A	P62491	216 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	DEFB136	Q30KP8	78 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	RAX2	Q96IS3	184 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	OR5B12	Q96R08	314 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	CCL24	O00175	119 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	TSPAN15	O95858	294 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	MYCNOS	P40205	109 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	OPRK1	P41145	380 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	S100A10	P60903	97 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	ZNF616	Q08AN1	781 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793		Q6ZNX1	250 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	OR11H1	Q8NG94	326 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	OR4C12	Q96R67	309 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	TXN2	Q99757	166 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793		A0A087WW49	117 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	LINC01619	G3V211	115 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793		H3BP45	60 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793		L7N2F9	121 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	DEDD	O75618	318 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	OR8U8	P0C7N1	319 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	VAMP2	P63027	116 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RAD18-208	ENST00000469793	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RAD18-208	ENST00000469793	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RAD18-208	ENST00000469793	PRSS46	E5RG02	174 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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