RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466995.5

TIMM17B-205, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM17B, Length 1,528 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17B-205ENST00000466995 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa11.81□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 MED28Q9H204 178 aa11.81□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 NPY1RP25929 384 aa11.8□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 CXorf58Q96LI9 332 aa11.8□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 ANK2Q01484 3957 aa11.79□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 MFSD2BA6NFX1 497 aa11.79□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 OPRK1P41145 380 aa11.79□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 UBAC2Q8NBM4 344 aa11.79□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 OR11H1Q8NG94 326 aa11.79□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 DPF1Q92782 380 aa11.79□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 U3KQ87 197 aa11.79□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 H3BP45 60 aa11.78□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 I3L521 148 aa11.78□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 L7N2F9 121 aa11.78□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 CCL24O00175 119 aa11.78□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 CORTO00230 105 aa11.78□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 MBPP02686 304 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 IFNA4P05014 189 aa11.78□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 VAMP2P63027 116 aa11.78□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 RPP30P78346 268 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 ID3Q02535 119 aa11.78□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 SPANXN5Q5MJ07 72 aa11.78□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 NOXA1Q86UR1 476 aa11.78□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 OR1N2Q8NGR9 330 aa11.78□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 RAX2Q96IS3 184 aa11.78□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa11.77□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 MT-CO2P00403 227 aa11.77□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 IGHV3-48P01763 117 aa11.77□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 OR8U8P0C7N1 319 aa11.77□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa11.77□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 C2orf83Q53S99 150 aa11.77□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 Q56UQ5 140 aa11.77□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 ZNF343Q6P1L6 599 aa11.77□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 CLEC19AQ6UXS0 136 aa11.77□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 PSENENQ9NZ42 101 aa11.77□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
TIMM17B-205ENST00000466995 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 A0A087WW49 117 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 TRBV12-3P01733 135 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 H2BFSP57053 126 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 RAB11AP62491 216 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 RUNX1Q01196 453 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 ZNF616Q08AN1 781 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 BSXQ3C1V8 233 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 VN1R17PQ8TDU5 208 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 SCARB1Q8WTV0 552 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 RAB40CQ96S21 281 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 C21orf62Q9NYP8 219 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 PPP5D1E7EU14 171 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 LINC01619G3V211 115 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 K7EIM0 57 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 K7EPK0 472 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 LY86O95711 162 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 GPR183P32249 361 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 MYCNOSP40205 109 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 BCAP31P51572 246 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 CYCSP99999 105 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 RAB32Q13637 225 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 FCN2Q15485 313 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 KLK9Q2XQG4 91 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 FAM209BQ5JX69 171 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 ACSM6Q6P461 480 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 CCDC140Q96MF4 163 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 NMES1Q9C002 83 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 KLK9Q9UKQ9 250 aa11.76□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 OR2T8A6NH00 312 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 I3L2K1 104 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 ARL3P36405 182 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 ETV3LQ6ZN32 361 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 ZNF502Q8TBZ5 544 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 TMEM170AQ8WVE7 144 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 OR4C12Q96R67 309 aa11.75□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 C15orf62A8K5M9 175 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 CLEC3BP05452 202 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 CXCL3P19876 107 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 ZP3P21754 424 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 CAV2P51636 162 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 SLURP1P55000 103 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 MFAP4P55083 255 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 RPEL1Q2QD12 228 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 SMIM8Q96KF7 97 aa11.74□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 GNG7O60262 68 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 RLN2P04090 185 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 CD33P20138 364 aa11.73□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
TIMM17B-205ENST00000466995 ETFRF1Q6IPR1 90 aa11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms