RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466359.1

NFX1-205, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 3

Gene NFX1, Length 391 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-205	ENST00000466359	MYOD1	P15172	320 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	SPN	P16150	400 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	NPBWR1	P48145	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	INSL3	P51460	131 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	MFAP2	P55001	183 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	TPPP2	P59282	170 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	OR4X1	Q8NH49	305 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	RBKS	Q9H477	322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359		F8W735	103 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	LINC01619	G3V211	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	NDUFB8	O95169	186 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM50A	O95807	157 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	CLEC3B	P05452	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	CTSG	P08311	255 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	PET100	P0DJ07	73 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	LYL1	P12980	280 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	NPY1R	P25929	384 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	MFAP4	P55083	255 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	PAX9	P55771	341 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	H2BFS	P57053	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	RAB11A	P62491	216 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF616	Q08AN1	781 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	C5orf51	A6NDU8	294 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359		K7EMT4	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359		K7EPK0	472 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	SSNA1	O43805	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	CLN5	O75503	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	DEDD	O75618	318 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	OR2J3	O76001	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	MT-CO2	P00403	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	IFNA10	P01566	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	RLN2	P04090	185 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	RAP2B	P61225	183 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	CD69	Q07108	199 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	FGL1	Q08830	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359		Q6ZNX1	250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	DCUN1D4	Q92564	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	MED28	Q9H204	178 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NFX1-205	ENST00000466359	ALG5	Q9Y673	324 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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