RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD55Q3KP44 614 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 SPINK9Q5DT21 86 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 C21orf62Q9NYP8 219 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 I3L2K1 104 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 CSN3P07498 182 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC25A6P12236 298 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF846Q147U1 533 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 BSXQ3C1V8 233 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM106AQ4KMX7 169 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 SPSB3Q6PJ21 355 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 TXN2Q99757 166 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 FLVCR2Q9UPI3 526 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 TMED3Q9Y3Q3 217 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 C9orf170A2RU37 121 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 CORTO00230 105 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 IGLV1-51P01701 117 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR183P32249 361 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 PLET1Q6UQ28 207 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 MISP3Q96FF7 219 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAH3Q8TD57 4116 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 F8W735 103 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 K7EIL1 84 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 TGOLN2O43493 480 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 PITX3O75364 302 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 MT-CO2P00403 227 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4E1P0C645 316 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 HTR2BP41595 481 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 MFAP4P55083 255 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 MRAPQ8TCY5 172 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 HSPB7Q9UBY9 170 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 CEBPZOSA8MTT3 80 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 TCRBP04435 133 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFRSF9Q07011 255 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 DHRS2Q13268 280 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 LYG2Q86SG7 212 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 COQ8AQ8NI60 647 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 HIPK2Q9H2X6 1198 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2T8A6NH00 312 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 ELLP55199 621 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 C2orf83Q53S99 150 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 NOXA1Q86UR1 476 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 C2orf70A6NJV1 201 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 A8MWP6 167 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM90A26D6RGX4 464 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 UPK1BO75841 260 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 CTSGP08311 255 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 SPNP16150 400 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 ASAH1Q13510 395 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 C4orf46Q504U0 113 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 Q56UQ5 140 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 MZT2BQ6NZ67 158 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 DUSP18Q8NEJ0 188 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2K2Q8NGT1 345 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 OR1S1Q8NH92 325 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 C20orf85Q9H1P6 137 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 PALMDQ9NP74 551 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 TBC1D24Q9ULP9 559 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 U3KQ87 197 aa12.81□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF320A2RRD8 509 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 NDUFA4O00483 81 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 HOXB5P09067 269 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 CBLN1P23435 193 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 ADMP35318 185 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 NPBWR1P48145 328 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 GGNBP1Q5YKI7 109 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 UBAC2Q8NBM4 344 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC24A4Q8NFF2 622 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 DTD1Q8TEA8 209 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 MARC2Q969Z3 335 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 CHRDL1Q9BU40 450 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 UFC1Q9Y3C8 167 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM213A2RRL7 107 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 C8orf88P0DMB2 117 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 FOLR2P14207 255 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 GP9P14770 177 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 RELQ04864 619 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 MITD1Q8WV92 249 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGEF1-204ENST00000442563 PRR25Q96S07 402 aa12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms