RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439555.2

IRF1-204, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene IRF1, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-204ENST00000439555 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF1-204ENST00000439555 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF1-204ENST00000439555 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF1-204ENST00000439555 OR4C46A6NHA9 309 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF1-204ENST00000439555 GABARAPH6UMI1 98 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF1-204ENST00000439555 MT-CO2P00403 227 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF1-204ENST00000439555 CD5P06127 495 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF1-204ENST00000439555 APOC4P55056 127 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF1-204ENST00000439555 TAS2R19P59542 299 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF1-204ENST00000439555 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF1-204ENST00000439555 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF1-204ENST00000439555 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF1-204ENST00000439555 UBAC2Q8NBM4 344 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF1-204ENST00000439555 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF1-204ENST00000439555 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF1-204ENST00000439555 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF1-204ENST00000439555 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
IRF1-204ENST00000439555 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
IRF1-204ENST00000439555 RABL2BQ9UNT1 228 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF1-204ENST00000439555 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.53□□□□□ -1.04
IRF1-204ENST00000439555 A0A0B4J293 547 aa8.52□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.52□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 CORTO00230 105 aa8.52□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 IGKV1-5P01602 117 aa8.52□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 UCP1P25874 307 aa8.52□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 SNCAP37840 140 aa8.52□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 NPBWR1P48145 328 aa8.52□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 ALDH3B2P48448 385 aa8.52□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 MISP3Q96FF7 219 aa8.52□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.52□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 TP53RKQ96S44 253 aa8.52□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 COPZ2Q9P299 210 aa8.52□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 CHEK1O14757 476 aa8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 GNG7O60262 68 aa8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 RAB3DO95716 219 aa8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 PI3P19957 117 aa8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 BMI1P35226 326 aa8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 AKR1C2P52895 323 aa8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 MEF2DQ14814 521 aa8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 AARDQ4LEZ3 155 aa8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 STEAP1BQ6NZ63 245 aa8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 GPR141Q7Z602 305 aa8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 FAM219AQ8IW50 185 aa8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 TMEM116Q8NCL8 245 aa8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 DUSP18Q8NEJ0 188 aa8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 BCL7BQ9BQE9 202 aa8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 GINS3Q9BRX5 216 aa8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 MIXL1Q9H2W2 232 aa8.51□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 CTDSPLO15194 276 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 RGS5O15539 181 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 ST8SIA3O43173 380 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 YIF1AO95070 293 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 CDS2O95674 445 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 IFNA17P01571 189 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 TRIM16LQ309B1 348 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 STPG3Q8N7X2 389 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 SLC35G3Q8N808 338 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 OR4D10Q8NGI6 311 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 OR52E5Q8NH55 327 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 GALNT14Q96FL9 552 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 RNF2Q99496 336 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 PDCD10Q9BUL8 212 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.5□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.49□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 CTDSP2O14595 271 aa8.49□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 SPRY2O43597 315 aa8.49□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 PAFAH1B2P68402 229 aa8.49□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 TNFRSF9Q07011 255 aa8.49□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 BSXQ3C1V8 233 aa8.49□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 SP6Q3SY56 376 aa8.49□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa8.49□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.49□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 ZNF600Q6ZNG1 722 aa8.49□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 RAB2BQ8WUD1 216 aa8.49□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 SMIM4Q8WVI0 70 aa8.49□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.49□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 VSIRQ9H7M9 311 aa8.49□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.49□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.48□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 DISC1C4P0D8 188 aa8.48□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 SCGB2A1O75556 95 aa8.48□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 TMEM50AO95807 157 aa8.48□□□□□ -1.05
IRF1-204ENST00000439555 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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