RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421827.2

UBXN11-208, Transcript of UBX domain protein 11, human

TSL 5

Gene UBXN11, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN11-208	ENST00000421827	SLC35G3	Q8N808	338 aa		13.59	□□□□□ -0.23
UBXN11-208	ENST00000421827	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
UBXN11-208	ENST00000421827	NAA60	Q9H7X0	242 aa		13.59	□□□□□ -0.23
UBXN11-208	ENST00000421827	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
UBXN11-208	ENST00000421827		A0A0G2JRQ6	117 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	HAGH	Q16775	308 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		13.58	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	MT-CO2	P00403	227 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	CTSG	P08311	255 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	SNCA	P37840	140 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	MFAP4	P55083	255 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	DHODH	Q02127	395 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	FAM219A	Q8IW50	185 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	DEFB125	Q8N687	156 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	TXN2	Q99757	166 aa		13.57	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	OR11H12	B2RN74	326 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	ETV6	P41212	452 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827		Q6ZRM9	215 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	MCUB	Q9NWR8	336 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827		K7EMT4	169 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	IGHV3-48	P01763	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	SPATA25	Q9BR10	227 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	ENY2	Q9NPA8	101 aa		13.55	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	C15orf62	A8K5M9	175 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	S100A5	P33763	92 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	AARD	Q4LEZ3	155 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	PYDC2	Q56P42	97 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827		V9GYH0	126 aa		13.54	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	C3orf84	H3BNL1	204 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	GNG7	O60262	68 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	SPCS3	P61009	180 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	OR52E5	Q8NH55	327 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	TMEM230	Q96A57	120 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	GPR146	Q96CH1	333 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	GALNT14	Q96FL9	552 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
UBXN11-208	ENST00000421827	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	YIF1A	O95070	293 aa		13.52	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	NPBWR1	P48145	328 aa		13.52	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	AP3S2	P59780	193 aa		13.52	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	TMEM187	Q14656	261 aa		13.52	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		13.52	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	IL22RA2	Q969J5	263 aa		13.52	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	TRIM63	Q969Q1	353 aa		13.52	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	CITED4	Q96RK1	184 aa		13.52	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	CACNG5	Q9UF02	275 aa		13.52	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	CORT	O00230	105 aa		13.51	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	TSPAN4	O14817	238 aa		13.51	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	AKR1C4	P17516	323 aa		13.51	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	CCDC190	Q86UF4	302 aa		13.51	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		13.51	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	MUC7	Q8TAX7	377 aa		13.51	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	OR10C1	Q96KK4	312 aa		13.51	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	SMPX	Q9UHP9	88 aa		13.51	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		13.5	□□□□□ -0.25
UBXN11-208	ENST00000421827	ZNF79	Q15937	498 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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