RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF439Q8NDP4 499 aa15.24■□□□□ 0.03
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SH3BP1-202ENST00000417536 GGTLC3B5MD39 225 aa15.2■□□□□ 0.02
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SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV1-46P01743 117 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-202ENST00000417536 CDKN1AP38936 164 aa15.2■□□□□ 0.02
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SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA1644Q3SXP7 199 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-202ENST00000417536 TIGITQ495A1 244 aa15.19■□□□□ 0.02
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SH3BP1-202ENST00000417536 OR5AU1Q8NGC0 362 aa15.19■□□□□ 0.02
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SH3BP1-202ENST00000417536 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.19■□□□□ 0.02
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SH3BP1-202ENST00000417536 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa15.18■□□□□ 0.02
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SH3BP1-202ENST00000417536 SELENOVP59797 346 aa15.18■□□□□ 0.02
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SH3BP1-202ENST00000417536 VN1R17PQ8TDU5 208 aa15.18■□□□□ 0.02
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SH3BP1-202ENST00000417536 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
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