RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
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PGGT1B-202ENST00000379615 DMRT1Q9Y5R6 373 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-202ENST00000379615 MFSD2BA6NFX1 497 aa11.81□□□□□ -0.52
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PGGT1B-202ENST00000379615 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa11.79□□□□□ -0.52
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PGGT1B-202ENST00000379615 SCGB2A1O75556 95 aa11.77□□□□□ -0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 MT-CO2P00403 227 aa11.77□□□□□ -0.53
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PGGT1B-202ENST00000379615 BSXQ3C1V8 233 aa11.77□□□□□ -0.53
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PGGT1B-202ENST00000379615 PVRIGQ6DKI7 326 aa11.77□□□□□ -0.53
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC24A4Q8NFF2 622 aa11.77□□□□□ -0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 DTD1Q8TEA8 209 aa11.77□□□□□ -0.53
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PGGT1B-202ENST00000379615 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 PALMDQ9NP74 551 aa11.77□□□□□ -0.53
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF320A2RRD8 509 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 NXPH3O95157 252 aa11.76□□□□□ -0.53
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PGGT1B-202ENST00000379615 ETFRF1Q6IPR1 90 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 RBKSQ9H477 322 aa11.76□□□□□ -0.53
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PGGT1B-202ENST00000379615 OPRK1P41145 380 aa11.75□□□□□ -0.53
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PGGT1B-202ENST00000379615 IFITM3Q01628 133 aa11.75□□□□□ -0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 RELQ04864 619 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 UFC1Q9Y3C8 167 aa11.75□□□□□ -0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 IL5P05113 134 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A4P12235 298 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP10-11P60412 298 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 UXS1Q8NBZ7 420 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 OR52B4Q8NGK2 314 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 WRBO00258 174 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFA4O00483 81 aa11.73□□□□□ -0.53
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