RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368378.7

THBS3-201, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,145 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-201ENST00000368378 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 VPS25Q9BRG1 176 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 CLCF1Q9UBD9 225 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 C11orf53Q8IXP5 236 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 TCF19Q9Y242 345 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 WIPI2Q9Y4P8 454 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 C21orf140B9A014 251 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 ENSAO43768 121 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 AMTP48728 403 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 SCGB2A2Q13296 93 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 GABRA6Q16445 453 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 OR9G1Q8NH87 305 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 NAGKQ9UJ70 344 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 M0QZ24 198 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 OR5G3P0C626 314 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 PMCHL1Q16048 86 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 MDS2Q8NDY4 140 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 TAAR6Q96RI8 345 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 NGBQ9NPG2 151 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 TMEM250H0YL14 139 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 K7EN84 100 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 STAG3L2P0CL84 134 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 PYYP10082 97 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 NPY1RP25929 384 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 CHRNB4P30926 498 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 OR10J1P30954 320 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 LEMD1Q68G75 181 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 LCN12Q6JVE5 192 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 OR2T6Q8NHC8 308 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 CXXC4Q9H2H0 198 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.31□□□□□ -1.24
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THBS3-201ENST00000368378 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 CCL3L1P16619 93 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 CENPWQ5EE01 88 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 HCP5Q6MZN7 132 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 TMEM178AQ8NBL3 297 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 RNF114Q9Y508 228 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 CREBBPQ92793 2442 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 ZNF253O75346 499 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 CRYGCP07315 174 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 GNG4P50150 75 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 FAM27E3Q08E93 113 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 EFNB3Q15768 340 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 MORN2Q502X0 79 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 OR4A47Q6IF82 309 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 CCL17Q92583 94 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 AGMATQ9BSE5 352 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 TPPP3Q9BW30 176 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 S4R3C0 116 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 J3QR06 171 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 RAB29O14966 203 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 BRI3O95415 125 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 HPRT1P00492 218 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 IRF2P14316 349 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 ORM2P19652 201 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 GCHFRP30047 84 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 ZNF137PP52743 207 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 RANP62826 216 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 MORN5Q5VZ52 161 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 MMD2Q8IY49 270 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 RCHY1Q96PM5 261 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 HELTA6NFD8 242 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 IQCF6A8MYZ5 107 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 SRIP30626 198 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 CEACAM3P40198 252 aa7.3□□□□□ -1.24
THBS3-201ENST00000368378 TNFSF10P50591 281 aa7.3□□□□□ -1.24
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