RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 OR2D2Q9H210 308 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 KCNK15Q9H427 330 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 ACOT13Q9NPJ3 140 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 SLC2A8Q9NY64 477 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 V9GY05 133 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 A0A075B6Q4 140 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 PGPEP1LA6NFU8 196 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 CRYZL1O95825 349 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 DHFRP00374 187 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 IGLV2-23P01705 113 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 CRYGBP07316 175 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 CSN3P07498 182 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 CTXN2P0C2S0 81 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 GSTT2P0CG29 244 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 GSTT2BP0CG30 244 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 CLDN12P56749 244 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 RHOGP84095 191 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 ARFRP1Q13795 201 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 ANKRD55Q3KP44 614 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 FAM106AQ4KMX7 169 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 IGSF11Q5DX21 431 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 LAIR2Q6ISS4 152 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM91Q6ZNR0 172 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 SLC16A13Q7RTY0 426 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 PRSS48Q7RTY5 328 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 NECAP1Q8NC96 275 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 OR10R2Q8NGX6 335 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 VSTM2AQ8TAG5 236 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 DYNLRB2Q8TF09 96 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 ACOT12Q8WYK0 555 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 OVOL2Q9BRP0 275 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 CCDC90BQ9GZT6 254 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 EDA2RQ9HAV5 297 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 SDHAF2Q9NX18 166 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 OR11H12B2RN74 326 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 CYB5BO43169 146 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 XRCC3O43542 346 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 GGCTO75223 188 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 SCGNO76038 276 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 FCGR3AP08637 254 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 APELAP0DMC3 54 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 CD36P16671 472 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 DTYMKP23919 212 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 MYL9P24844 172 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 DUTP33316 252 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 MAS1LP35410 378 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 RPS25P62851 125 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 IRF3Q14653 427 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 CDK10Q15131 360 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 GUCA2BQ16661 112 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 HES5Q5TA89 166 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 IL34Q6ZMJ4 242 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 Q6ZS49 121 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 TTC9CQ8N5M4 171 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 OR11H4Q8NGC9 324 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 MGLLQ99685 303 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 OR51E2Q9H255 320 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 DCSTAMPQ9H295 470 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 VCX3BQ9H321 246 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 DUSP21Q9H596 190 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 BLOC1S6Q9UL45 172 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 RYR2Q92736 4967 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 IZUMO1RA6ND01 250 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 C2orf70A6NJV1 201 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 IFITM5A6NNB3 132 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 LGALS9O00182 355 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 MFNGO00587 321 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 FCGR3BO75015 233 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 OR2J3O76001 311 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 HRASP01112 189 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 TRBV12-3P01733 135 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 HLA-DQB1P01920 261 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 DEFA4P12838 97 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 RAB3BP20337 219 aa3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms