RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 SCN8AQ9UQD0 1980 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-201ENST00000332175 H3BRM9 83 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-201ENST00000332175 CD55P08174 381 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-201ENST00000332175 TTC32Q5I0X7 151 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-201ENST00000332175 FGFBP3Q8TAT2 258 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-201ENST00000332175 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-201ENST00000332175 METRNQ9UJH8 293 aa18.67■□□□□ 0.58
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PTPRM-201ENST00000332175 OTORQ9NRC9 128 aa18.65■□□□□ 0.58
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PTPRM-201ENST00000332175 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa18.65■□□□□ 0.58
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PTPRM-201ENST00000332175 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa18.62■□□□□ 0.57
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PTPRM-201ENST00000332175 VKORC1Q9BQB6 163 aa18.61■□□□□ 0.57
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PTPRM-201ENST00000332175 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
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PTPRM-201ENST00000332175 MLNRO43193 412 aa18.59■□□□□ 0.57
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PTPRM-201ENST00000332175 FABP5P3A8MUU1 101 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-201ENST00000332175 WNT2P09544 360 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-201ENST00000332175 CFHR1Q03591 330 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-201ENST00000332175 RP1P56715 2156 aa18.59■□□□□ 0.57
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PTPRM-201ENST00000332175 PVRIGQ6DKI7 326 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRM-201ENST00000332175 DPH3P1Q9H4G8 78 aa18.58■□□□□ 0.57
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