RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 AWAT1Q58HT5 328 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 FOXH1O75593 365 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 MOSP00540 346 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 OR10J1P30954 320 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 ATP5J2P56134 94 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 CACNG8Q8WXS5 425 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 ACY3Q96HD9 319 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.29□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 TEX22C9J3V5 150 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 MFAP2P55001 183 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 HES1Q14469 280 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 NRGNQ92686 78 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 SLC35E1Q96K37 410 aa14.28□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.27□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 NBR2O15453 112 aa14.27□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 MINOS1Q5TGZ0 78 aa14.27□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa14.27□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 ABHD5Q8WTS1 349 aa14.27□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 RPS10P5Q9NQ39 176 aa14.27□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa14.27□□□□□ -0.12
ACTB-201ENST00000331789 C7orf77A4D0Y5 90 aa14.27□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 H3BQ15 152 aa14.27□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 PSMB3P49720 205 aa14.27□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 CD81P60033 236 aa14.27□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 NPBQ8NG41 125 aa14.27□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.26□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 A1L4Q6 167 aa14.26□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 VWC2LB2RUY7 222 aa14.26□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 UBE2E1P51965 193 aa14.26□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 FAM90A2PQ658T7 463 aa14.26□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa14.26□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.26□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 MISP3Q96FF7 219 aa14.26□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 AJUBAQ96IF1 538 aa14.26□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 OOSP1A8MZH6 123 aa14.25□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 PAGE4O60829 102 aa14.25□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 NDUFA3O95167 84 aa14.25□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 CNIH1O95406 144 aa14.25□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa14.25□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 PVRIGQ6DKI7 326 aa14.25□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 ZNF114Q8NC26 417 aa14.25□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 NPIPB3Q92617 1050 aa14.25□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 PERPQ96FX8 193 aa14.25□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 MANBALQ9NQG1 85 aa14.25□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 COL12A1Q99715 3063 aa14.25□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 STAG3L2P0CL84 134 aa14.25□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 STAG3L3P0CL85 134 aa14.25□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 ARL14EPLP0DKL9 152 aa14.25□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 CLEC2AQ6UVW9 174 aa14.25□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.24□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 RHOBP62745 196 aa14.24□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 EPG5Q9HCE0 2579 aa14.24□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa14.23□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 COX6B1P14854 86 aa14.23□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 TMEM249Q2WGJ8 235 aa14.23□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa14.23□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 OR1P1Q8NH06 330 aa14.23□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.23□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14.23□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa14.23□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 NDUFS8O00217 210 aa14.23□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 CXorf1O96002 111 aa14.23□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 RND2P52198 227 aa14.23□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 UBE2G2P60604 165 aa14.23□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 C5orf64Q2M2E5 130 aa14.23□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 FAM120AOSQ5T036 256 aa14.23□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.23□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.23□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 Q8N6K4 173 aa14.23□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 OR4F5Q8NH21 305 aa14.23□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 MALSU1Q96EH3 234 aa14.23□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 OR4F4Q96R69 305 aa14.23□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 CRYGCP07315 174 aa14.22□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 SAA4P35542 130 aa14.22□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 PAX8Q06710 450 aa14.22□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 EBI3Q14213 229 aa14.22□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 FXYD3Q14802 87 aa14.22□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 FAM78BQ5VT40 261 aa14.22□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 TVP23CQ96ET8 276 aa14.22□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa14.22□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 SMCO4Q9NRQ5 59 aa14.22□□□□□ -0.13
ACTB-201ENST00000331789 SPG11Q96JI7 2443 aa14.22□□□□□ -0.13
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