RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 TCF23Q7RTU1 214 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 ZNRF1Q8ND25 227 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 TLN2Q9Y4G6 2542 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 PRSS47A8MTI9 375 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 DIRC3C9JPN6 131 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 H3BP45 60 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 TMPRSS2O15393 492 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 NDUFB3O43676 98 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 PPYP01298 95 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 TFF1P04155 84 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 COL8A1P27658 744 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 S100A7P31151 101 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 LRRC10Q5BKY1 277 aa8.34□□□□□ -1.07
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GINS3-201ENST00000318129 ZNF525Q8N782 197 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 OR4F5Q8NH21 305 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 NUDT11Q96G61 164 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 COQ2Q96H96 371 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 OR4F4Q96R69 305 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 RAB9BQ9NP90 201 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 IGKV1D-33P01593 117 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 IGKV1-33P01594 117 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 GPR146Q96CH1 333 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 CST9LQ9H4G1 147 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 BET1LQ9NYM9 111 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-201ENST00000318129 ODAMA1E959 279 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 LY6HO94772 140 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 CRISP2P16562 243 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 ARL16Q0P5N6 197 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 EDDM3AQ14507 147 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 CR1LQ2VPA4 569 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 Q6ZPA2 131 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.33□□□□□ -1.08
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GINS3-201ENST00000318129 KRTDAPP60985 99 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 RHOGP84095 191 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
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GINS3-201ENST00000318129 SGMS2Q8NHU3 365 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.33□□□□□ -1.08
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GINS3-201ENST00000318129 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 RNF24Q9Y225 148 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 NDUFS7O75251 213 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 IGHV4-39P01824 125 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 GPX1P07203 203 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 ATP5J2P56134 94 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 EDDM3BP56851 147 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 Q0VG73 95 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 OR8B3Q8NGG8 313 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 OR8B2Q96RD0 313 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 NAV2Q8IVL1 2488 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 hADV38S2A0JD32 116 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 F2Z2F3 143 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 NDUFS8O00217 210 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 SPINT2O43291 252 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 SCTP09683 121 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 DSCR9P59020 149 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 GALMQ96C23 342 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 GPHA2Q96T91 129 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 KRASP01116 189 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 BAGE3Q86Y29 109 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 BAGE2Q86Y30 109 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 A0A0G2JRQ6 117 aa8.31□□□□□ -1.08
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