RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 F8W735 103 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 BMPR1BO00238 502 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 SIX6O95475 246 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 SNCAP37840 140 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 MYCNOSP40205 109 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 TATDN3Q17R31 274 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 DTD1Q8TEA8 209 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 ENY2Q9NPA8 101 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 I3L2K1 104 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 WRBO00258 174 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM50AO95807 157 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 MT-CO2P00403 227 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 IFNA21P01568 189 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 ID3Q02535 119 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 DCUN1D4Q92564 292 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 C5orf51A6NDU8 294 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 LINC01619G3V211 115 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 H3BP45 60 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 PRAF2O60831 178 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 SCGB1D2O95969 90 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 CLEC3BP05452 202 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 IGLL1P15814 213 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 GPR183P32249 361 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 DPF1Q92782 380 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 ALG5Q9Y673 324 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 FBN3Q75N90 2809 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 C7orf66A4D0T2 115 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 C15orf62A8K5M9 175 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 G3V4G9 280 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 GOSR2O14653 212 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 SYNGR2O43760 224 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 OR2C1O95371 312 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 IFNA10P01566 189 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 CD33P20138 364 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 RGS21Q2M5E4 152 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 C1QL4Q86Z23 238 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 THYN1Q9P016 225 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 OR2T8A6NH00 312 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 SSSCA1O60232 199 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 EDN2P20800 178 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 NPY1RP25929 384 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 ADMP35318 185 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 HTR2BP41595 481 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 PAX9P55771 341 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 H2BFSP57053 126 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 IL15RAQ13261 267 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 OXA1LQ15070 435 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 C2orf83Q53S99 150 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 CXorf58Q96LI9 332 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 OR4C12Q96R67 309 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-201ENST00000309641 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-201ENST00000309641 OR8U8P0C7N1 319 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-201ENST00000309641 ARL3P36405 182 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-201ENST00000309641 OPRK1P41145 380 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-201ENST00000309641 SYNJ2BPP57105 145 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-201ENST00000309641 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-201ENST00000309641 C2orf50Q96LR7 162 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-201ENST00000309641 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-201ENST00000309641 CYB5BO43169 146 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-201ENST00000309641 SSNA1O43805 119 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-201ENST00000309641 CCNKO75909 580 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-201ENST00000309641 CXCL3P19876 107 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-201ENST00000309641 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-201ENST00000309641 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-201ENST00000309641 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-201ENST00000309641 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.95□□□□□ -1.3
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