RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 GAMTQ14353 236 aa8.37□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 PEA15Q15121 130 aa8.37□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 MIC13Q5XKP0 118 aa8.37□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.37□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.37□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 ABHD5Q8WTS1 349 aa8.37□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 SSMEM1Q8WWF3 244 aa8.37□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 C1orf159Q96HA4 380 aa8.37□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.37□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 CORTO00230 105 aa8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 GATA3P23771 443 aa8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 B2MP61769 119 aa8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 FXYD3Q14802 87 aa8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 STPG3Q8N7X2 389 aa8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 OR1P1Q8NH06 330 aa8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 MISP3Q96FF7 219 aa8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 HIF1ANQ9NWT6 349 aa8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 C1RLQ9NZP8 487 aa8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 F8W036 122 aa8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 PPT1P50897 306 aa8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 Q5PR19 223 aa8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 FAM120AOSQ5T036 256 aa8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 LINC01356Q8N9X3 169 aa8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 ARPC1AQ92747 370 aa8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 ACY3Q96HD9 319 aa8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 POLQO75417 2590 aa8.35□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.35□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 SEC14L6B5MCN3 397 aa8.35□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 C9JQL5 133 aa8.35□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 CYB5BO43169 146 aa8.35□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 YIF1AO95070 293 aa8.35□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.35□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 DEFA4P12838 97 aa8.35□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 MFAP2P55001 183 aa8.35□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 MLANAQ16655 118 aa8.35□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 HAGHQ16775 308 aa8.35□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.35□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 BRD3OSQ6XYD6 125 aa8.35□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 C19orf35Q6ZS72 473 aa8.35□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.35□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 RAB24Q969Q5 203 aa8.35□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 SEC11CQ9BY50 192 aa8.35□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 GNG13Q9P2W3 67 aa8.35□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 CENPEQ02224 2701 aa8.35□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 OR10J1P30954 320 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 PRR20EP86478 221 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 PRR20CP86479 221 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 PRR20DP86480 221 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 PRR20BP86481 221 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 PRR20AP86496 221 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 DEFA5Q01523 94 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 RARRES2Q99969 163 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 ABCA12Q86UK0 2595 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 A0A0U1RQK1 487 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 A0A1W2PPV4 95 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 ZFP92A6NM28 416 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 IFNA1P01562 189 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 HLA-DRB1P01911 266 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 BCL2P10415 239 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 RND2P52198 227 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 CX3CL1P78423 397 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 NDPQ00604 133 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 C10orf91Q5T1B1 145 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 Q8N9W7 124 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.34□□□□□ -1.07
COPS2-201ENST00000299259 RNF223E7ERA6 249 aa8.33□□□□□ -1.08
COPS2-201ENST00000299259 SCO1O75880 301 aa8.33□□□□□ -1.08
COPS2-201ENST00000299259 TSPAN9O75954 239 aa8.33□□□□□ -1.08
COPS2-201ENST00000299259 IGHV3-48P01763 117 aa8.33□□□□□ -1.08
COPS2-201ENST00000299259 CTRB1P17538 263 aa8.33□□□□□ -1.08
COPS2-201ENST00000299259 ICAM4Q14773 271 aa8.33□□□□□ -1.08
COPS2-201ENST00000299259 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.33□□□□□ -1.08
COPS2-201ENST00000299259 SVBPQ8N300 66 aa8.33□□□□□ -1.08
COPS2-201ENST00000299259 MBD6Q96DN6 1003 aa8.33□□□□□ -1.08
COPS2-201ENST00000299259 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.33□□□□□ -1.08
COPS2-201ENST00000299259 DMRT1Q9Y5R6 373 aa8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms