RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 TMEM14BQ9NUH8 114 aa7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 DAPK2Q9UIK4 370 aa7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 V9GYH0 126 aa7.49□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 FABP12A6NFH5 140 aa7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 J3QRK9 145 aa7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 MFNGO00587 321 aa7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 PTTG1O95997 202 aa7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 SERPINE2P07093 398 aa7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 BRWD1-AS2P59051 145 aa7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 PLA2G7Q13093 441 aa7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 Q56UQ5 140 aa7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 LEMD1Q68G75 181 aa7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 CNIH2Q6PI25 160 aa7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 TCF24Q7RTU0 167 aa7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 FAM3DQ96BQ1 224 aa7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 SOSTQ9BQB4 213 aa7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 COMMD3Q9UBI1 195 aa7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 RAB22AQ9UL26 194 aa7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 TBC1D24Q9ULP9 559 aa7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 CELA1Q9UNI1 258 aa7.48□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 FAM25AB3EWG3 89 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 FAM25CB3EWG5 89 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 FAM25GB3EWG6 89 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 F8W735 103 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 UPK2O00526 184 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 CTDSPLO15194 276 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 HPGDSO60760 199 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 YIF1AO95070 293 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 CTSGP08311 255 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 OR13C7P0DN81 318 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 OR10A3P58181 314 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 TAS2R31P59538 309 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 TNP2Q05952 138 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 ZNF79Q15937 498 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 POU2AF1Q16633 256 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 SAMD12Q8N8I0 201 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 DUSP18Q8NEJ0 188 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 GFI1Q99684 422 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 GINS3Q9BRX5 216 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
USP41-201ENST00000292729 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 A0A0A6YYH2 397 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 A6NJ64 397 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 SCGNO76038 276 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 TRAPPC2P0DI81 140 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 NQO2P16083 231 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 GNB3P16520 340 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 DTYMKP23919 212 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 ARL6IP1Q15041 203 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 OXA1LQ15070 435 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 TRIM16LQ309B1 348 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 TRIQKQ629K1 86 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 OR10W1Q8NGF6 305 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 LGALS14Q8TCE9 139 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 DEDD2Q8WXF8 326 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 ZNF414Q96IQ9 312 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 VSIRQ9H7M9 311 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 TAS2R8Q9NYW2 309 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.46□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.45□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa7.45□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa7.45□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 SMIM30A4D0T7 59 aa7.45□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 K7EIM0 57 aa7.45□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 ST8SIA3O43173 380 aa7.45□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 HPRT1P00492 218 aa7.45□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 IGKV1-13P0DP09 117 aa7.45□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 ELK1P19419 428 aa7.45□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 C4BPBP20851 252 aa7.45□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 CLDN12P56749 244 aa7.45□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 WT1-ASQ06250 92 aa7.45□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 IL18Q14116 193 aa7.45□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 MSMO1Q15800 293 aa7.45□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 SPAG16Q8N0X2 631 aa7.45□□□□□ -1.22
USP41-201ENST00000292729 GRAMD2BQ96HH9 432 aa7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms