RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SERF1AO75920 110 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 CYB5R2Q6BCY4 276 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 WDR83OSQ9Y284 106 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 S4R3C0 116 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-23P01764 117 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF600Q6ZNG1 722 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 LHFPL1Q86WI0 220 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 SDK2Q58EX2 2172 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 PVRIGQ6DKI7 326 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 ZIC4Q8N9L1 334 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 NRN1Q9NPD7 142 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 MTURNQ8N3F0 131 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 CACNA1DQ01668 2161 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV3-20P01619 116 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 C1QTNF9P0C862 333 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 MST1P26927 711 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 SAMD13Q5VXD3 122 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 FAM19A2Q8N3H0 131 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 TTC32Q5I0X7 151 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 CCL3L1P16619 93 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 CD69Q07108 199 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-201ENST00000284617 NBR2O15453 112 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 CEACAM1P13688 526 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 FOXC2Q99958 501 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 RAMP3O60896 148 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 DUTP33316 252 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 DEPPQ9NTK1 212 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 SEMA5BQ9P283 1151 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 PRCDQ00LT1 54 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 DNAL4O96015 105 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 CD55P08174 381 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 PSME4Q14997 1843 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 GFRA3O60609 400 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 NAPSAO96009 420 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 CD5P06127 495 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 ASCL2Q99929 193 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFAF3Q9BU61 184 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 WFDC1Q9HC57 220 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 EPDR1Q9UM22 224 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 FABP5P3A8MUU1 101 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 PAX1P15863 534 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD17AQ96GS6 310 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM133Q9H2Q1 129 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM242Q9NWH2 141 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 C19orf67A6NJJ6 358 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 KIF26BQ2KJY2 2108 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H2BKO60814 126 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H2BJP06899 126 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H2BOP23527 126 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H2BBP33778 126 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H2BDP58876 126 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H2BCP62807 126 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 HIST2H2BEQ16778 126 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 GCSAMLQ5JQS6 135 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H2BHQ93079 126 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H2BNQ99877 126 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H2BMQ99879 126 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 SLC50A1Q9BRV3 221 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 ABCA7Q8IZY2 2146 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 DOCK4Q8N1I0 1966 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV1D-12P01611 117 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 NIT1Q86X76 327 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 MRAP2Q96G30 205 aa17.62■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 LDLRAD4O15165 306 aa17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 PCP4P48539 62 aa17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC19AQ6UXS0 136 aa17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 ADMP35318 185 aa17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 HEPN1Q6WQI6 88 aa17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2CO00762 179 aa17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 EFNB3Q15768 340 aa17.61■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 MUC21A0A140T8X8 626 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 MUC21Q5SSG8 566 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 RNF125Q96EQ8 232 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00587B1AMM8 73 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 OCC1Q8TAD7 63 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM101Q96IK0 257 aa17.6■□□□□ 0.41
CCSAP-201ENST00000284617 EFNA2O43921 213 aa17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.5 ms