RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273317.4

LIMD1-201, Transcript of LIM domains containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMD1, Length 11,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-201ENST00000273317 WBP1LQ9NX94 342 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 SLC17A3O00476 420 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 WDR82Q6UXN9 313 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 DNASE2BQ8WZ79 361 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 ARPC1AQ92747 370 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 CTHRC1Q96CG8 243 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 A6NNC1 897 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
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LIMD1-201ENST00000273317 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 RPRMQ9NS64 109 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 NKX2-8O15522 239 aa6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.75□□□□□ -1.33
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LIMD1-201ENST00000273317 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.75□□□□□ -1.33
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LIMD1-201ENST00000273317 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.75□□□□□ -1.33
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LIMD1-201ENST00000273317 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.75□□□□□ -1.33
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LIMD1-201ENST00000273317 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.75□□□□□ -1.33
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LIMD1-201ENST00000273317 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.75□□□□□ -1.33
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LIMD1-201ENST00000273317 OR52E5Q8NH55 327 aa6.75□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.75□□□□□ -1.33
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LIMD1-201ENST00000273317 SMPXQ9UHP9 88 aa6.75□□□□□ -1.33
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LIMD1-201ENST00000273317 DPM2O94777 84 aa6.74□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 PLNP26678 52 aa6.74□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 RNF182Q8N6D2 247 aa6.74□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF815PA8K554 130 aa6.74□□□□□ -1.33
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LIMD1-201ENST00000273317 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.74□□□□□ -1.33
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LIMD1-201ENST00000273317 NRN1Q9NPD7 142 aa6.74□□□□□ -1.33
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LIMD1-201ENST00000273317 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.74□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 DUX3Q96PT4 197 aa6.74□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 PSMB11A5LHX3 300 aa6.74□□□□□ -1.33
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LIMD1-201ENST00000273317 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
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LIMD1-201ENST00000273317 CSRP3P50461 194 aa6.74□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 C19orf48Q6RUI8 117 aa6.74□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 OSTCQ9NRP0 149 aa6.74□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.74□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.73□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 RLFQ13129 1914 aa6.73□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 IL9P15248 144 aa6.73□□□□□ -1.33
LIMD1-201ENST00000273317 ZP1P60852 638 aa6.73□□□□□ -1.33
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