RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261889.9

SNX1-201, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX1, Length 3,373 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-201ENST00000261889 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
SNX1-201ENST00000261889 OR4A47Q6IF82 309 aa10.66□□□□□ -0.7
SNX1-201ENST00000261889 LINC00596Q86U02 117 aa10.66□□□□□ -0.7
SNX1-201ENST00000261889 SLC24A4Q8NFF2 622 aa10.66□□□□□ -0.7
SNX1-201ENST00000261889 OR52E5Q8NH55 327 aa10.66□□□□□ -0.7
SNX1-201ENST00000261889 ZNF586Q9NXT0 402 aa10.66□□□□□ -0.7
SNX1-201ENST00000261889 BMPR1BO00238 502 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX1-201ENST00000261889 MORN2Q502X0 79 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX1-201ENST00000261889 TEPPQ6URK8 271 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX1-201ENST00000261889 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa10.65□□□□□ -0.7
SNX1-201ENST00000261889 TMPRSS2O15393 492 aa10.65□□□□□ -0.7
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SNX1-201ENST00000261889 SPATA12Q7Z6I5 190 aa10.65□□□□□ -0.7
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SNX1-201ENST00000261889 ZNF503Q96F45 646 aa10.65□□□□□ -0.7
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SNX1-201ENST00000261889 TNXAQ16473 311 aa10.64□□□□□ -0.71
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SNX1-201ENST00000261889 IGF2-ASQ6U949 168 aa10.64□□□□□ -0.71
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SNX1-201ENST00000261889 ENY2Q9NPA8 101 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 A8MXE2 369 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 C15orf65H3BRN8 121 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 USF1P22415 310 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 PTTG1IPP53801 180 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 FAM216BQ8N7L0 139 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa10.64□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 CSN3P07498 182 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 OPRK1P41145 380 aa10.63□□□□□ -0.71
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SNX1-201ENST00000261889 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa10.63□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 CT45A1Q5HYN5 189 aa10.63□□□□□ -0.71
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SNX1-201ENST00000261889 CT45A3Q8NHU0 189 aa10.63□□□□□ -0.71
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SNX1-201ENST00000261889 VWC2Q2TAL6 325 aa10.62□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 SMIM21Q3B7S5 101 aa10.62□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 TIGITQ495A1 244 aa10.62□□□□□ -0.71
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SNX1-201ENST00000261889 TMEM136Q6ZRR5 245 aa10.62□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 NIT1Q86X76 327 aa10.62□□□□□ -0.71
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SNX1-201ENST00000261889 SLC35E1Q96K37 410 aa10.62□□□□□ -0.71
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SNX1-201ENST00000261889 MUC21A0A140T8X8 626 aa10.62□□□□□ -0.71
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SNX1-201ENST00000261889 hDV102S1A0JD36 115 aa10.62□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 J3QR06 171 aa10.62□□□□□ -0.71
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SNX1-201ENST00000261889 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 SLC35D1Q9NTN3 355 aa10.61□□□□□ -0.71
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SNX1-201ENST00000261889 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa10.61□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 ZFHX3Q15911 3703 aa10.61□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 IQCF6A8MYZ5 107 aa10.61□□□□□ -0.71
SNX1-201ENST00000261889 ISLRO14498 428 aa10.61□□□□□ -0.71
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