RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253814.5

NDFIP1-201, Transcript of Nedd4 family interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NDFIP1, Length 3,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1-201ENST00000253814 GFRA3O60609 400 aa14.52□□□□□ -0.08
NDFIP1-201ENST00000253814 ARL3P36405 182 aa14.52□□□□□ -0.08
NDFIP1-201ENST00000253814 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
NDFIP1-201ENST00000253814 FAM162BQ5T6X4 162 aa14.52□□□□□ -0.08
NDFIP1-201ENST00000253814 VSTM2AQ8TAG5 236 aa14.52□□□□□ -0.08
NDFIP1-201ENST00000253814 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
NDFIP1-201ENST00000253814 C11orf1Q9H5F2 150 aa14.52□□□□□ -0.08
NDFIP1-201ENST00000253814 PRRG2O14669 202 aa14.52□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 SNAI2O43623 268 aa14.52□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 TMEM177Q53S58 311 aa14.52□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 RNFT1Q5M7Z0 435 aa14.52□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 TMEM208Q9BTX3 173 aa14.52□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa14.51□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 PRR33A8MZF0 331 aa14.51□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 TNFSF13O75888 250 aa14.51□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 Q6ZSR3 168 aa14.51□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 FAM222BQ8WU58 562 aa14.51□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 PMCHL2Q9BQD1 86 aa14.51□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 J3QW42 95 aa14.51□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 NPPCP23582 126 aa14.51□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 ACP1P24666 158 aa14.51□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 TNFRSF19Q9NS68 423 aa14.51□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.51□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 C15orf61A6NNL5 157 aa14.51□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa14.51□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 LEPROTL1O95214 131 aa14.51□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 OR8A1Q8NGG7 326 aa14.51□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 ZNRD1Q9P1U0 126 aa14.51□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa14.51□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa14.51□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.091e-5■■■■□ 21.5
NDFIP1-201ENST00000253814 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.5□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 TMEM108Q6UXF1 575 aa14.5□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 PERPQ96FX8 193 aa14.5□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 F2Z2F3 143 aa14.5□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 FCER1GP30273 86 aa14.5□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 TDGF1P3P51864 188 aa14.5□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 GCSAMQ8N6F7 178 aa14.5□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 A8MWL6 223 aa14.5□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 DLEU1O43261 78 aa14.5□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 RELBQ01201 579 aa14.5□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 PMCHL1Q16048 86 aa14.5□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 TCF24Q7RTU0 167 aa14.5□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 Q8NFD4 153 aa14.5□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.5□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 KCNS1Q96KK3 526 aa14.5□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 SELENOKQ9Y6D0 94 aa14.5□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 CCL3L1P16619 93 aa14.49□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 LINC00305Q7Z4B0 112 aa14.49□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 IFI27L2Q9H2X8 130 aa14.49□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa14.49□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 DLL1O00548 723 aa14.49□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 CSN1S1P47710 185 aa14.49□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 TDRG1Q3Y452 100 aa14.49□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 Q6ZWC4 215 aa14.49□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa14.49□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 HIF1ANQ9NWT6 349 aa14.49□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 HIGD1CA8MV81 97 aa14.49□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 UQCRFS1P47985 274 aa14.49□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 LEMD1Q68G75 181 aa14.49□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 TMEM144Q7Z5S9 345 aa14.49□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 WDR31Q8NA23 367 aa14.49□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 SZT2Q5T011 3432 aa14.49□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 YPEL1O60688 119 aa14.48□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 RPEQ96AT9 228 aa14.48□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 YPEL2Q96QA6 119 aa14.48□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa14.48□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 SCGB2A2Q13296 93 aa14.48□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 CLEC5AQ9NY25 188 aa14.48□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 LAMA1P25391 3075 aa14.48□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 HYPMO75409 117 aa14.48□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa14.48□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 ZNF714Q96N38 554 aa14.48□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 NPSP0C0P6 89 aa14.47□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 MUC15Q8N387 334 aa14.47□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 KLK10O43240 276 aa14.47□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 TBR1Q16650 682 aa14.47□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 OR4F17Q8NGA8 305 aa14.47□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 FAM27E3Q08E93 113 aa14.47□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 NGBQ9NPG2 151 aa14.47□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 INSIG2Q9Y5U4 225 aa14.47□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 TRANK1O15050 2925 aa14.46□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 LMO1P25800 156 aa14.46□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 DNLZQ5SXM8 178 aa14.46□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa14.46□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 C19orf35Q6ZS72 473 aa14.46□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 DIRC2Q96SL1 478 aa14.46□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa14.46□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 MUC21A0A140T8X8 626 aa14.46□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 PEX7O00628 323 aa14.46□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 MUC21Q5SSG8 566 aa14.46□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 YPEL4Q96NS1 127 aa14.46□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 SFXN3Q9BWM7 321 aa14.46□□□□□ -0.09
NDFIP1-201ENST00000253814 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.2 ms