RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 CFHR4Q92496 578 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 SLC35E1Q96K37 410 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 SMIM7Q9BQ49 75 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 HILPDAQ9Y5L2 63 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 ACTL6BO94805 426 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 NPPCP23582 126 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 UBE2G2P60604 165 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 KIR3DL3Q8N743 410 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 ACY3Q96HD9 319 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 PARLQ9H300 379 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 FOXH1O75593 365 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 AREGP15514 252 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 PAX2Q02962 417 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF674Q2M3X9 581 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 RNF212Q495C1 297 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 VMO1Q7Z5L0 202 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF114Q8NC26 417 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 FCN1O00602 326 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 CEACAM3P40198 252 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 ATP5G3P48201 142 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 MFAP2P55001 183 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 FAM78BQ5VT40 261 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 NAT8Q9UHE5 227 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 A0A1W2PRD5 423 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 A0A1W2PRF3 423 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 A0A1W2PRM7 423 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 TEX22C9J3V5 150 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 GCHFRP30047 84 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 GNB1P62873 340 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 TMEM241Q24JQ0 296 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 FUT9Q9Y231 359 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 IGHV3-48P01763 117 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 CST9LP1Q5W188 147 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 C19orf35Q6ZS72 473 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 NANPQ8TBE9 248 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 NPIPB3Q92617 1050 aa14.77□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 CXorf65A6NEN9 183 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 PDE6DO43924 150 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 APELAP0DMC3 54 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 RAB5AP20339 215 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 LMO4P61968 165 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 LCN2P80188 198 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 OR51G1Q8NGK1 321 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 BPESC1Q9GZL8 116 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 SIRPDQ9H106 197 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 CRYGCP07315 174 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 THAP8Q8NA92 274 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 PSMB11A5LHX3 300 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 OR5G3P0C626 314 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 MMDQ15546 238 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 FBLN7Q53RD9 439 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF343Q6P1L6 599 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 OR1P1Q8NH06 330 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 TMEM37Q8WXS4 190 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 TXNDC17Q9BRA2 123 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 C19orf24Q9BVV8 132 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 AKAP6Q13023 2319 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 CD24P25063 80 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 RPL23P62829 140 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 PLGLAQ15195 96 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 ELOBQ15370 118 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 DYNAPQ8N1N2 210 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 NPBQ8NG41 125 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 MISP3Q96FF7 219 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 TMEM242Q9NWH2 141 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 CLN5O75503 358 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 MT-CO2P00403 227 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 MOSP00540 346 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 IGHV4-39P01824 125 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 ADIRFQ15847 76 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 SSX2Q16385 188 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 ZFP82Q8N141 532 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 MALSU1Q96EH3 234 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF503Q96F45 646 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 COL12A1Q99715 3063 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 F6UZH7 168 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 NBR2O15453 112 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 NDUFA3O95167 84 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 RND2P52198 227 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF90Q03938 601 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.9 ms